219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0766 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 298 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  70.23 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  66.41 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  67.8 
 
 		 265 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  62.92 
 
 		 255 aa  362  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  62.92 
 
 		 255 aa  362  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  65 
 
 		 255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  61.83 
 
 		 252 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  63.71 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  60.62 
 
 		 252 aa  338  9e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  55.77 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  55.89 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  55.89 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  56.11 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  51.41 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  51.41 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  55.77 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  54.92 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  54.17 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0485  hypothetical protein  52.38 
 
 		 276 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  54.17 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  54.17 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  54.17 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  54.17 
 
 		 304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  54.17 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  54.17 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  54.92 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  54.92 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  53.26 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  54.92 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  53.48 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  55.38 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  54.17 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  54.17 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  53.05 
 
 		 261 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  53.85 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0641  glutamine amidotransferase class-II  53.88 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0595  glutamine amidotransferase class-II  53.49 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000149447  normal  0.350686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  53.08 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  53.64 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  51.54 
 
 		 257 aa  281  9e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  46.92 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2290  glutamine amidotransferase, class-II  45.65 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006238 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  44.79 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  46.15 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  45 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  45 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  45.91 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  45 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  45 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  44.4 
 
 		 283 aa  245  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  44.62 
 
 		 255 aa  245  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  45 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  45 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  45 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  42.91 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  44.62 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  44.32 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  45 
 
 		 255 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  44.36 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  45 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  45 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  44.32 
 
 		 259 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  44.32 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  44.4 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  44.32 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  44.4 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  43.94 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  43.13 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  42.97 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  45.59 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1034  glutamine amidotransferase class-II  44.44 
 
 		 261 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0785028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  43.45 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  43.45 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  42.42 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  43.45 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  44.44 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  43.18 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  44.02 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  42.91 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  43.63 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  44.4 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2065  glutamine amidotransferase, class-II protein  42.35 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2388  glutamine amidotransferase, class-II  41.99 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.570173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  43.68 
 
 		 257 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  44.4 
 
 		 266 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  43.35 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  43.68 
 
 		 257 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  40 
 
 		 261 aa  228  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  41.13 
 
 		 261 aa  228  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  45.1 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  44.44 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>