187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2322 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 279 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  98.84 
 
 		 259 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  98.84 
 
 		 259 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  96.53 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  93.05 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  93.05 
 
 		 259 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  93.05 
 
 		 259 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  92.66 
 
 		 259 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  91.86 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  85.21 
 
 		 261 aa  480  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  83.98 
 
 		 258 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  82.81 
 
 		 261 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  83.2 
 
 		 259 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  82.68 
 
 		 256 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1869  amidotransferase  82.81 
 
 		 269 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.120168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  80.47 
 
 		 258 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  67.97 
 
 		 281 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  66.28 
 
 		 281 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  66.27 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  66.15 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  66.15 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  66.15 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  65.76 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  66.54 
 
 		 255 aa  359  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  358  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  66.93 
 
 		 257 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  66.93 
 
 		 257 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  65.76 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  65.76 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  64.98 
 
 		 255 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  65.12 
 
 		 281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  66.54 
 
 		 257 aa  355  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  66.02 
 
 		 268 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  64.2 
 
 		 255 aa  352  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  64.98 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  62.5 
 
 		 265 aa  348  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  64.59 
 
 		 255 aa  346  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  64.2 
 
 		 255 aa  345  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  60.94 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  61.48 
 
 		 266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  61.72 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  60.55 
 
 		 262 aa  322  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  60.55 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  59.69 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  60.55 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  58.59 
 
 		 257 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  60.16 
 
 		 257 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  58.59 
 
 		 257 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  58.98 
 
 		 257 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  57.03 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  57.48 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  57.49 
 
 		 283 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  57.09 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  55.47 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  57.09 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  57.32 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1034  glutamine amidotransferase class-II  55.81 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0785028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  54.86 
 
 		 258 aa  295  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  53.49 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  53.75 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  52.73 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  52.92 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  53.28 
 
 		 260 aa  278  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  49.41 
 
 		 257 aa  275  8e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  50.78 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  50.78 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  51.15 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  51.78 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  49.61 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  47.51 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  49.41 
 
 		 255 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  48.44 
 
 		 328 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  50 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  49.02 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  47.51 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  48.86 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  49.02 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  48.63 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  48.63 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  51.76 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  48.24 
 
 		 305 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  49.01 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  49.22 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.84 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  49.21 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  47.84 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.84 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.84 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.84 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.84 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  49.21 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  48.12 
 
 		 265 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0198915 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>