198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1034 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1034  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0785028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  81.08 
 
 
283 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  80.71 
 
 
301 aa  427  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  80.71 
 
 
273 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  80.08 
 
 
263 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  80.08 
 
 
263 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  60.66 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  60.66 
 
 
257 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  60.66 
 
 
257 aa  313  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  58.96 
 
 
268 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  59.84 
 
 
255 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  59.84 
 
 
255 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  59.84 
 
 
255 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  59.43 
 
 
255 aa  308  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.967151 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  59.43 
 
 
255 aa  308  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  59.43 
 
 
255 aa  308  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  59.43 
 
 
255 aa  308  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  59.43 
 
 
255 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  59.43 
 
 
255 aa  308  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  59.43 
 
 
255 aa  307  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  59.35 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  58.61 
 
 
255 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  58.61 
 
 
255 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  58.61 
 
 
255 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  58.61 
 
 
255 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  58.61 
 
 
255 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  58.94 
 
 
255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  58.17 
 
 
255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  58.54 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  55.78 
 
 
255 aa  301  9e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  55.34 
 
 
275 aa  300  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  57.38 
 
 
281 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  55.81 
 
 
279 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  55.81 
 
 
259 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  55.81 
 
 
259 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  55.04 
 
 
259 aa  295  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  56.68 
 
 
259 aa  295  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  54.65 
 
 
259 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  56.68 
 
 
256 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  54.65 
 
 
259 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  54.65 
 
 
259 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  54.65 
 
 
259 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  57.14 
 
 
281 aa  291  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  55.08 
 
 
258 aa  291  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  54.12 
 
 
261 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  54.9 
 
 
281 aa  289  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  55.74 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  54.41 
 
 
261 aa  287  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  54.12 
 
 
259 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  55.28 
 
 
258 aa  285  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1869  amidotransferase  56.91 
 
 
269 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.120168  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  55.73 
 
 
259 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  53.97 
 
 
270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  51.78 
 
 
260 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  54.98 
 
 
277 aa  268  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  53.54 
 
 
258 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  49.21 
 
 
277 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  48.62 
 
 
255 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  48.21 
 
 
257 aa  258  8e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  54.18 
 
 
257 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  49.8 
 
 
276 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  54.88 
 
 
257 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  48.8 
 
 
255 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  48.41 
 
 
255 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  54.88 
 
 
257 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  52.99 
 
 
262 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  53.78 
 
 
257 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  49.4 
 
 
261 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  48.8 
 
 
255 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  52.4 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  47.49 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  52.17 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  49.6 
 
 
268 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  48.4 
 
 
255 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  53.81 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  52.59 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  47.83 
 
 
301 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  53.81 
 
 
257 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  48.21 
 
 
260 aa  248  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  47.6 
 
 
275 aa  248  7e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  48.61 
 
 
259 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  48.21 
 
 
276 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  46.46 
 
 
311 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  46.46 
 
 
311 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  47.41 
 
 
276 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  47.41 
 
 
276 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  47.45 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  48.21 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  47.45 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.45 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.45 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.45 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.45 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2184  hypothetical protein  48.24 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.817401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  47.06 
 
 
328 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0485  hypothetical protein  47.41 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  47.06 
 
 
304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  47.33 
 
 
303 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  45.8 
 
 
265 aa  241  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  47.45 
 
 
305 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>