193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3888 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 		 257 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  94.16 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  93.77 
 
 		 257 aa  507  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  93.39 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  87.45 
 
 		 262 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  87.55 
 
 		 258 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  87.06 
 
 		 266 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  80.93 
 
 		 257 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  79.3 
 
 		 257 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  76.17 
 
 		 257 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  75.78 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  62.5 
 
 		 258 aa  348  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  64.45 
 
 		 270 aa  348  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  59.38 
 
 		 277 aa  331  7.000000000000001e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  59.46 
 
 		 281 aa  319  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  61.11 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1869  amidotransferase  60.38 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.120168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  60.63 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  61.02 
 
 		 255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  59.38 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  61.11 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  61.11 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  61.11 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  61.11 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  61.11 
 
 		 255 aa  311  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  59.13 
 
 		 275 aa  311  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  60.63 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  60.63 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  60.63 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  60.63 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  58.98 
 
 		 279 aa  310  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  60.63 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  60.63 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  60.63 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  60.63 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  58.59 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  58.59 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  60.63 
 
 		 255 aa  308  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  59.14 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  60.24 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  61.02 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  59.92 
 
 		 268 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  56.44 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  58.3 
 
 		 258 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  55.25 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  56.64 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  59.07 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  59.07 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  58.1 
 
 		 259 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  57.81 
 
 		 259 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  57.42 
 
 		 256 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  59.45 
 
 		 257 aa  299  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  59.45 
 
 		 257 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  57.53 
 
 		 259 aa  299  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  59.45 
 
 		 257 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  60.32 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  58.69 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  59.92 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  54.69 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  54.72 
 
 		 255 aa  288  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  53.85 
 
 		 277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  55.37 
 
 		 301 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  55.37 
 
 		 273 aa  271  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  54.15 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  53.12 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  54.96 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  53.75 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  52.19 
 
 		 259 aa  262  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  52.8 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  50.2 
 
 		 311 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  51.39 
 
 		 257 aa  260  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  50.76 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  49.81 
 
 		 311 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  50.38 
 
 		 303 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  49.03 
 
 		 301 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  50 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  50 
 
 		 305 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  50 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  56.05 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  53.36 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  50.19 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  50.79 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2290  glutamine amidotransferase, class-II  46.21 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  50.4 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1034  glutamine amidotransferase class-II  53.81 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0785028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  50.79 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  50.2 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  48.65 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.65 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  48.65 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  48.26 
 
 		 327 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  49.6 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.65 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.65 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.65 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.65 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  49.8 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  43.53 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0641  glutamine amidotransferase class-II  49.22 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0595  glutamine amidotransferase class-II  49.22 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000149447  normal  0.350686 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>