176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2290 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2290  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 304 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2388  glutamine amidotransferase, class-II  77.85 
 
 		 307 aa  520  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.570173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2065  glutamine amidotransferase, class-II protein  77.52 
 
 		 307 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  48.38 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  48.92 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  49.82 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  50.72 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  50 
 
 		 255 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  49.28 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  46.72 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  48.19 
 
 		 265 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  48.01 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  48 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  48.36 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  46.76 
 
 		 281 aa  255  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  46.21 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  46.79 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  46.79 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  46.79 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  48.18 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  45.71 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  45.71 
 
 		 281 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  45.49 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  46.21 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  45.68 
 
 		 257 aa  252  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  45.68 
 
 		 257 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  45.13 
 
 		 257 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  45.71 
 
 		 305 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  45.68 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  49.09 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  46.1 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  45.2 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  45.49 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  43.33 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  45.2 
 
 		 311 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  46.45 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  43.33 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  45.16 
 
 		 266 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  46.55 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  46.57 
 
 		 275 aa  249  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  46.04 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  45.13 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  45.65 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  46.55 
 
 		 257 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  43.86 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  44.44 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  44.44 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  44.44 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  44.44 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  44.44 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  44.44 
 
 		 255 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  45.49 
 
 		 327 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  44.6 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  44.6 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  45.52 
 
 		 257 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  45.16 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  44.8 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  44.6 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  46.04 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  46.21 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  45.85 
 
 		 316 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  45.85 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  45.85 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  44.24 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0485  hypothetical protein  45.13 
 
 		 276 aa  244  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  44.24 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  44.24 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  44.24 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  44.24 
 
 		 255 aa  244  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  44.93 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  44.24 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  46.18 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  44.29 
 
 		 277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  47.45 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  42.96 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  47.08 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0641  glutamine amidotransferase class-II  45.62 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0595  glutamine amidotransferase class-II  44.53 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000149447  normal  0.350686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  43.68 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  43.42 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  42.5 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  42.86 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  43.68 
 
 		 257 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  42.86 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  40.21 
 
 		 265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  43.12 
 
 		 259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  43.37 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  42.81 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  41.94 
 
 		 261 aa  232  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  42.47 
 
 		 273 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  41.58 
 
 		 258 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  42.35 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  43.84 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  43.37 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  42.5 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>