178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1765 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 258 aa  540  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  86.33 
 
 		 261 aa  474  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  85.16 
 
 		 259 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  84.77 
 
 		 256 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  84.77 
 
 		 259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  84.77 
 
 		 259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  83.98 
 
 		 279 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  85.21 
 
 		 261 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1869  amidotransferase  81.78 
 
 		 269 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.120168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  83.2 
 
 		 259 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  82.81 
 
 		 259 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  82.81 
 
 		 259 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  81.25 
 
 		 259 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  82.81 
 
 		 259 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  82.42 
 
 		 259 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  80.62 
 
 		 258 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  67.19 
 
 		 281 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  67.44 
 
 		 275 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  67.58 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  66.02 
 
 		 281 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  67.58 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  67.58 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  67.19 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  67.19 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  67.19 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  67.19 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  67.19 
 
 		 255 aa  362  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  64.34 
 
 		 265 aa  360  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  67.19 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  66.8 
 
 		 255 aa  355  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  64.84 
 
 		 255 aa  355  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1821  hypothetical protein  64.06 
 
 		 281 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  64.06 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  64.06 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  64.06 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  64.06 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  64.06 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  64.45 
 
 		 257 aa  348  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  65.35 
 
 		 268 aa  348  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  64.45 
 
 		 257 aa  348  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  64.45 
 
 		 257 aa  348  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  63.67 
 
 		 255 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  64.84 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  64.45 
 
 		 255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  64.84 
 
 		 255 aa  342  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  59.53 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  59.45 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  58.98 
 
 		 266 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  58.2 
 
 		 262 aa  314  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  58.75 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  58.37 
 
 		 257 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  58.37 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  58.37 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  57.98 
 
 		 257 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  58.59 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  56.81 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  55.25 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  58.54 
 
 		 283 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  57.32 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  57.32 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  56.08 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  55.29 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  53.52 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  54.09 
 
 		 277 aa  289  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  53.91 
 
 		 258 aa  288  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1034  glutamine amidotransferase class-II  55.28 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0785028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  54.3 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  51.95 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  51.16 
 
 		 277 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  52.17 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  49.61 
 
 		 311 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  49.61 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  51.36 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  49.61 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  48.62 
 
 		 257 aa  268  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  49.21 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  50 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  48.44 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  48.44 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  49.8 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  49.61 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  49.61 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  48.05 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0485  hypothetical protein  49.61 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  48.05 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  47.55 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  48.44 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  48.05 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  48.05 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  48.05 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.44 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.44 
 
 		 304 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  48.44 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  48.44 
 
 		 316 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  47.01 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.44 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.44 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  48.44 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  49.81 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  48.44 
 
 		 275 aa  254  7e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>