More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11079 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  64.44 
 
 
285 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  54.35 
 
 
290 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  49.14 
 
 
296 aa  278  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  53.02 
 
 
294 aa  275  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  46.9 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  45.61 
 
 
291 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  43.49 
 
 
288 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  33.09 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  33.71 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  31.97 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  26.96 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  31.84 
 
 
254 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  27.94 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  30.05 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  28.24 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  27.81 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  33.96 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  34.42 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  27.4 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  29.61 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  29.61 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  31.46 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  29.01 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  29.07 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  35.43 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  30.06 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  35.43 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  34.71 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  35.43 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  28.46 
 
 
257 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  26.71 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  34.55 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  34.45 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  32.46 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  28.66 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  26.44 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  28.83 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  29.01 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  32.46 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  27.03 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  28.83 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  27.6 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  24.23 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  28.83 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  27.76 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  27.18 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  26 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  27.08 
 
 
327 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  24.34 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  27.74 
 
 
359 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47330  hypothetical protein  27.69 
 
 
257 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  30.43 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  27.69 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  32.8 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0234  glutamine amidotransferase, class-II  34.03 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127824  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  34.03 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139071 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0244  glutamine amidotransferase, class-II  34.03 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  26.51 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  26.43 
 
 
276 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  30.7 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  27.82 
 
 
279 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  26.67 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.21 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  28.21 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  26.44 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  28.21 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.21 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  30.04 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  30.07 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  26.85 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  23.9 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  26.44 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  29.14 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2290  glutamine amidotransferase, class-II  25.44 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006238 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.21 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  26.85 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.21 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  27.86 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  30.2 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3295  glutamine amidotransferase class-II  23.6 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3442  glutamine amidotransferase class-II  23.22 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  26.11 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  26.28 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  29.52 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  29.52 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  27.47 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  27.15 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0230  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.51 
 
 
612 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  25.87 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  30.8 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2921  glutamine amidotransferase, class-II  35.81 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0460423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  27.95 
 
 
264 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  30.26 
 
 
279 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  25.91 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  32.89 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0595  glutamine amidotransferase class-II  27.48 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000149447  normal  0.350686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>