More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0244 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0234  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0244  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2921  glutamine amidotransferase, class-II  74.81 
 
 
264 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0460423 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1554  putative glutamine amidotransferase  30.32 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30050  predicted glutamine amidotransferase  35.2 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  29.77 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  29.28 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  29.28 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  29.28 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  36.2 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0485  hypothetical protein  30.42 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0569  glutamine amidotransferase, class-II  29.28 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00722251  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  28.16 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  28.16 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.16 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.16 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.16 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.16 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  28.16 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  32.55 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  30.26 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  32.04 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  32.04 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  34 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  27.8 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  34.03 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  29.12 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  31.82 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  32.1 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  26.36 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  29.77 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  33 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  32.85 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  37.93 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  28.14 
 
 
301 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  34.9 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  29.47 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  29.47 
 
 
311 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0595  glutamine amidotransferase class-II  29.36 
 
 
299 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000149447  normal  0.350686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  25.49 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  30.17 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0641  glutamine amidotransferase class-II  29.49 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  30.59 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  28.37 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  26 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2804  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38.74 
 
 
611 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3200  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38.74 
 
 
611 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  30.39 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  32.61 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  28.5 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  32.07 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5030  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.07 
 
 
608 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  29.41 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  29.57 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  30.98 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0925  glutamine amidotransferase class-II  29.06 
 
 
255 aa  58.9  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.795597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  29.01 
 
 
257 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0231  glutamine amidotransferase class-II  34 
 
 
277 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  22.26 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  22.26 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  34.4 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 
610 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0892  glutamine amidotransferase class-II  29.86 
 
 
255 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  28.93 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  31.53 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  26.42 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1805  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.41 
 
 
609 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  30.46 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  27.4 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  27.4 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  30.3 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  27.4 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2884  hypothetical protein  29.79 
 
 
304 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  25 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  25 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  25 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  28.43 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  25 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4716  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  43.96 
 
 
605 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2933  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.35 
 
 
609 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.850684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  25 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  26.92 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4910  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.34 
 
 
608 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 
609 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  29.82 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  25 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  29.82 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12612  predicted protein  28.65 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4273  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  40 
 
 
614 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.985947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26.79 
 
 
612 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03202  hypothetical protein  28.57 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2184  hypothetical protein  32.83 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.817401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2854  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
608 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
586 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  31.25 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  25.45 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  26.79 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  30.52 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>