More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2003 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  64.44 
 
 
287 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  52.54 
 
 
290 aa  282  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  53.12 
 
 
294 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  49.83 
 
 
296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  49.13 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  44.71 
 
 
291 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  44.86 
 
 
288 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  40 
 
 
257 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  40 
 
 
257 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  39.35 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  39.26 
 
 
254 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  30.71 
 
 
273 aa  92.4  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  28.78 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  27.14 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  27.14 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  34.42 
 
 
218 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  26.57 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  34.84 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  35.06 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  32.54 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  38.26 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  38.26 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  33.12 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  29.49 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  29.3 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  36.52 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  27.88 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  37.12 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  32.43 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  34.42 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  34.9 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  34.9 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  33.77 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  33.11 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  33.77 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  34.23 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  33.12 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  29.47 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  34.23 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  29.47 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  27.92 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  29.7 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  26.09 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  31.17 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  28.34 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  32.89 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  32.89 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  34.23 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  32.89 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  33.56 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  28.64 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  32.89 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2921  glutamine amidotransferase, class-II  34.27 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0460423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  32.21 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  34.9 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  33.56 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  29.62 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  29.49 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  28.85 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  28.62 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  28.57 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  28.57 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  35.62 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  28.25 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  27.09 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  31.33 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0535  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  29.2 
 
 
606 aa  65.1  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.241436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  32.54 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  27.7 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  33.55 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  30 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  30.57 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  30 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  35.11 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  31.25 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  29.39 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0234  glutamine amidotransferase, class-II  29.39 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  34.38 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0244  glutamine amidotransferase, class-II  29.39 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1360  glutamine amidotransferase, class-II  35.11 
 
 
281 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1259  glutamine amidotransferase, class-II  35.11 
 
 
281 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0598  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  32.07 
 
 
611 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  33.5 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  26.52 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0015  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.08 
 
 
610 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5170  glutamine amidotransferase class-II  27.34 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 
610 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2589  glutamine amidotransferase, class-II  33.59 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.06 
 
 
610 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  25.85 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  34.85 
 
 
247 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  30.52 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  29.67 
 
 
255 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>