194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0600 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  100 
 
 		 264 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  72.35 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  72.35 
 
 		 264 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  71.59 
 
 		 264 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  61.02 
 
 		 260 aa  329  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  62.02 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  57.61 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  58.44 
 
 		 269 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  53.53 
 
 		 287 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  55.08 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  53.23 
 
 		 270 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  52.53 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  53.08 
 
 		 263 aa  268  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  50 
 
 		 271 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  53.63 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  52.94 
 
 		 261 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  45.6 
 
 		 254 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  52.1 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  52.1 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  52.1 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  48.95 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  49.4 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  49 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  49 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  51.55 
 
 		 218 aa  224  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  50.2 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  39.49 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  41.22 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  38.55 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  39.27 
 
 		 277 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  39.42 
 
 		 277 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  39.05 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  38.32 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  38.57 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  38.57 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  38.69 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  40.73 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  38.69 
 
 		 288 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  37.59 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  38.69 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  37.96 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  38.69 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  38.32 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  40.36 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  40.36 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  40.36 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  40.36 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  40.36 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  40.36 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  40.36 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  39.05 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  33.21 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  33.21 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  34.22 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  34.22 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  35.83 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  32.68 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  33.33 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  28.28 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  32.95 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.567722 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  30.32 
 
 		 381 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  32.86 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  33.06 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  34.25 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  33.61 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37436  predicted protein  28.16 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.17911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  36.21 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02390  cytoplasm protein, putative  29.65 
 
 		 406 aa  102  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.20974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2649  hypothetical protein  32.56 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33024  predicted protein  29.76 
 
 		 529 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7302  hypothetical protein  32.7 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  33.21 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2884  hypothetical protein  28.97 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0330  hypothetical protein  31.01 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  0.833255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  41.67 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  30.86 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5170  glutamine amidotransferase class-II  30.5 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2649  hypothetical protein  26.33 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  34.64 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  29.84 
 
 		 229 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2778  hypothetical protein  25.67 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1080  hypothetical protein  28.33 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  31.27 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  29.92 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4513  hypothetical protein  30.08 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.610304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  29.37 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  32.37 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  28.41 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  31.54 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  31.95 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  28.34 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4880  hypothetical protein  26.52 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4969  hypothetical protein  26.52 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5248  hypothetical protein  26.52 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  26.14 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  31.22 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  28.66 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  24.31 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  32.26 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  28.3 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>