147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  58.58 
 
 		 248 aa  278  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  57.02 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  57.63 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5170  glutamine amidotransferase class-II  54.04 
 
 		 245 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  45.45 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2649  hypothetical protein  43.25 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1080  hypothetical protein  40.56 
 
 		 282 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0330  hypothetical protein  44.86 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  0.833255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7302  hypothetical protein  46.72 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4513  hypothetical protein  44.67 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.610304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4880  hypothetical protein  41.35 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4969  hypothetical protein  41.35 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5248  hypothetical protein  41.35 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  42.06 
 
 		 231 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  42.26 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  45.3 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  40.16 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  42.98 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  40.59 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  34.54 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  32.94 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  32.94 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  35.97 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  34.1 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  35.71 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  35.71 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  34.13 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  36.99 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  37.01 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  37.43 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  38.31 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  32.34 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  32.49 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  31.42 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  32.46 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  32.46 
 
 		 288 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  37.94 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  32.46 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  36.89 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  33.87 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  35.68 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  32.71 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  37.63 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  36.8 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  29.36 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  38.41 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  36.56 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  32.71 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  32.71 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  32.71 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  32.71 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  32.71 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  32.71 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  32.71 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  36.81 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  36.81 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  34.68 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  37.91 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  39.33 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  31.58 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  31.97 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  31.23 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  35.96 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  35.96 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  38.32 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  33.06 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  36.02 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  36.02 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  31.27 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  29.84 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  35.78 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  35.55 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  30.12 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  34.74 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  30.12 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  34.41 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  31.64 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  35.03 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  32.64 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  35 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  29.05 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  29.18 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  31.95 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  30.65 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  27.31 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  28.25 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  28.63 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  26.27 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  28.95 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  27.02 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  30.04 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  27.31 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  29.53 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0403  glutamine amidotransferase, class-II  26.69 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  27.31 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2884  hypothetical protein  30.72 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0485  hypothetical protein  27.31 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  25.37 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>