More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4078 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  59.39 
 
 		 296 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  57.34 
 
 		 296 aa  321  8e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  53.12 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  53.02 
 
 		 287 aa  275  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  53.9 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  48.11 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  45.3 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  31.93 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  38.95 
 
 		 257 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  38.42 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  33.21 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  37.79 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  26.98 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  26.82 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  32.02 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  26.14 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  34.87 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  28.57 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  26.25 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  29.2 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  30 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  28.69 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  28.34 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  34.57 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  27.53 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  28.78 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  34.21 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  37.21 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  26.92 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  29.43 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  28.83 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  35.66 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  33.55 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  27.4 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  32.89 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  32.89 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  32.89 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  30.48 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  32.89 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  29.27 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  34.21 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  37.41 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  32.14 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  34.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  30.69 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  34.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  34.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  30.69 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  34.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  34.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  34.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  28.57 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  34.21 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  28.57 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  31.9 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  30.04 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  26.32 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  24.31 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  27.94 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  26.45 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  26.94 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  26.46 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  32.76 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  28.47 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  27.47 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  29.52 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  35.9 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  29.52 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  28.78 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  28.78 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  35.19 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  31.37 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  28.66 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  24.45 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  28.27 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  28.65 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  26.71 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  32.24 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0191  glutamine amidotransferase, class-II  27.36 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490407  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2453  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  33.33 
 
 		 606 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.633572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0674  glutamine amidotransferase, class-II  27.36 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0347409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  32.24 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  28.04 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  32.24 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  34.19 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3761  glutamine amidotransferase, class-II  27.36 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  27.46 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  27.59 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  27.17 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  28.24 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  27.55 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  27.55 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  29.73 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  29.73 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  27.17 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  27.55 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  27.18 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  27.75 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  27.55 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>