120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2474 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  59.23 
 
 
260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  42.23 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  38.98 
 
 
262 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  38.98 
 
 
262 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  39.27 
 
 
264 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  38.6 
 
 
271 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  36.4 
 
 
262 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  35.63 
 
 
269 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  30.88 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  30.88 
 
 
283 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0330  hypothetical protein  38.34 
 
 
234 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  0.833255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  37.45 
 
 
274 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  36.72 
 
 
252 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  36.45 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  35.21 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  36.14 
 
 
247 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  33.98 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  33.98 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  35.21 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  35.21 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  32.94 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  35.78 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  34.59 
 
 
281 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  33.59 
 
 
287 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  33.74 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  34.27 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  33.85 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  34.25 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  36.36 
 
 
260 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5170  glutamine amidotransferase class-II  38.61 
 
 
245 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  34.46 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  29.62 
 
 
275 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2649  hypothetical protein  35.32 
 
 
243 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  39.74 
 
 
242 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  37.67 
 
 
264 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  33.21 
 
 
275 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4513  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.610304  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  37.67 
 
 
264 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7302  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  31.44 
 
 
340 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  33.07 
 
 
243 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  37.21 
 
 
264 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  30.68 
 
 
277 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  31.44 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  31.44 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  31.44 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  31.44 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  31.44 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  31.44 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  31.44 
 
 
278 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  31.58 
 
 
233 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  32.44 
 
 
263 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  31.71 
 
 
229 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  31.6 
 
 
277 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  32.71 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  32.71 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  30.8 
 
 
231 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  30.3 
 
 
277 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  28.27 
 
 
359 aa  98.6  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  30.89 
 
 
277 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  30.89 
 
 
288 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  30.89 
 
 
306 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  34.07 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  29.92 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  30.19 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  45.76 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  29.39 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  32.54 
 
 
229 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1080  hypothetical protein  34.78 
 
 
282 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  32.41 
 
 
261 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  32.06 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4880  hypothetical protein  30.04 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4969  hypothetical protein  30.04 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5248  hypothetical protein  30.04 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  29.55 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  32.71 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  31.84 
 
 
218 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  32.71 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  32.71 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  32.54 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  26.97 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37436  predicted protein  25.83 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.17911  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33024  predicted protein  26.67 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102029  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  31.66 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  31.41 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  31.46 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02390  cytoplasm protein, putative  27.06 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.20974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  28.83 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  27.83 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  29.34 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2884  hypothetical protein  28.91 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2649  hypothetical protein  27.36 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2778  hypothetical protein  26.23 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  28.96 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  29.5 
 
 
288 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>