More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0250 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 		 296 aa  597  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  78.04 
 
 		 296 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  59.39 
 
 		 294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  49.14 
 
 		 287 aa  278  8e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  49.83 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  50 
 
 		 290 aa  254  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  43.88 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  44.09 
 
 		 288 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  33.7 
 
 		 257 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  32.25 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  37.8 
 
 		 257 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  30.1 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  35.02 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  29.7 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  29.32 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  29.26 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  28.57 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  28.57 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  28.2 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  28.2 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  33.19 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  30.04 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  28.2 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  29.21 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  27.23 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  27.72 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  27.44 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  29.06 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  31.03 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  27.44 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  26.03 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1869  amidotransferase  27.6 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.120168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  27.65 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  24.47 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  28.32 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  27.88 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  26.84 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  29.25 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  27.95 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  27.83 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  26.7 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  27.9 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  27.95 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  29.06 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  29.07 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  29.07 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  28.45 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  29.63 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  30.99 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  27.88 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  27.88 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  27.88 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  27.88 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  27.88 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0435  glutamine amidotransferase class-II  30.99 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  27.88 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  27.88 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  27.88 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  27.88 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  28.12 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  27.47 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  33.53 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  28.09 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  29.46 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  29.24 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  28.77 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  28.44 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  35.09 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  34.9 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  27.9 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0234  glutamine amidotransferase, class-II  34.9 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0244  glutamine amidotransferase, class-II  34.9 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  33.72 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  27.39 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  28.44 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  26.02 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  28.44 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  34.26 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  26.54 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  25.66 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  25.66 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  29.24 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  27.33 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  25.66 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0760  glutamine amidotransferase, class-II  25.56 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  25.66 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  25.66 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  25.42 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1336  glutamine amidotransferase, class-II  24.23 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  29.13 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  29.65 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  31.82 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  27.83 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2308  putative amidotransferase  30.09 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  28.69 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  28 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  26.2 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  31.34 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  26.84 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  30.43 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>