More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4344 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  78.04 
 
 		 296 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  57.34 
 
 		 294 aa  321  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  49.13 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  46.9 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  49.3 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  43.49 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  41.33 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  31.4 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  31.54 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  33.33 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  33.33 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  24.82 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  30.32 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  27.23 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1784  glutamine amidotransferase, class-II  30 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578377  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  26.92 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3734  glutamine amidotransferase, class-II  31.75 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  27.14 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  27.14 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3888  glutamine amidotransferase class-II  28.3 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1308  glutamine amidotransferase, class-II  25.36 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00128669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  26.39 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4103  glutamine amidotransferase class-II  26.07 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  26.74 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  27.9 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00218  predicted amidotransfease  29.32 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3397  glutamine amidotransferase class-II  29.32 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3384  glutamine amidotransferase class-II  29.32 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0220  glutamine amidotransferase, class II  29.32 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  27.61 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0251  glutamine amidotransferase, class II  29.32 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00222  hypothetical protein  29.32 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0257  glutamine amidotransferase, class II  29.32 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  26.02 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0236  glutamine amidotransferase, class II  29.32 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0642816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5929  glutamine amidotransferase class-II  30.04 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4975  glutamine amidotransferase class-II  27.07 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.0648382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0335  glutamine amidotransferase, class-II  27.61 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0268  glutamine amidotransferase, class II  29.32 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.967151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0324  glutamine amidotransferase class-II  27.61 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  24.9 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  27.41 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  25.77 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0661  glutamine amidotransferase class-II  27.78 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.0600355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5266  glutamine amidotransferase class-II  29.48 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.411892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  27.52 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4581  hypothetical protein  26.79 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  27.65 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3909  hypothetical protein  26.89 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1576  glutamine amidotransferase, class-II  26.42 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  26.57 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  22.73 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  28.63 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  25.91 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  29.63 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  29.95 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  32.68 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4461  glutamine amidotransferase class-II  27.07 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  30.19 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0234  glutamine amidotransferase, class-II  34.4 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1870  glutamine amidotransferase, class-II  24.81 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  34.4 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1034  glutamine amidotransferase class-II  27.82 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0785028 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0244  glutamine amidotransferase, class-II  34.4 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  25.28 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  27.38 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  24.91 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  25.28 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2921  glutamine amidotransferase, class-II  36.7 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0460423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  26.3 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4925  glutamine amidotransferase class-II  27.07 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.722368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  25.19 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  25.1 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  27.97 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  31.79 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  25.29 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  25.28 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3372  glutamine amidotransferase, class-II  33.11 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3931  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  33.33 
 
 		 607 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  29.76 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2589  glutamine amidotransferase, class-II  35.19 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  28.44 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  26.15 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  25.83 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3307  glutamine amidotransferase class-II  27.62 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.567804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  25.83 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  28.66 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  25.83 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  25.83 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  25.64 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  31.37 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3168  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  27.62 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3318  class II glutamine amidotransferases domain-containing protein  27.62 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  26.54 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4084  hypothetical protein  25.43 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  25.83 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0708  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  34.23 
 
 		 612 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  25.83 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32880  Glutamine amidotransferase, class-II protein  32.39 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>