222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5275 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  100 
 
 
288 aa  578  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  68.04 
 
 
291 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  48.21 
 
 
290 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  45.3 
 
 
294 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  43.49 
 
 
287 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  44.86 
 
 
285 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0250  glutamine amidotransferase class-II  44.09 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4344  glutamine amidotransferase, class-II  43.49 
 
 
296 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  33.97 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  32.95 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  33.46 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  32.82 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  27.71 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  33.07 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  33.07 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  33.07 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  32.52 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  32.27 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  34.62 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  31.71 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  32.38 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  32.38 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  30.54 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  30.32 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  29.85 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  29.12 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  33.8 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  31.86 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  30.36 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  31.86 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  30.85 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  33.02 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  33.02 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  33.02 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  33.02 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  33.02 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  33.02 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  33.02 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  31.14 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  26.87 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  26.53 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  33.12 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  28.85 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  28.85 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  27.42 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  31.22 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2184  hypothetical protein  29.32 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.817401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  32.35 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  34.17 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  32.5 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  32.4 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  28.02 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  27.59 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  31.28 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  34.67 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  31.28 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  26.44 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  26.44 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  30.58 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  30.49 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  37.72 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  29.5 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  27.02 
 
 
271 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  28.74 
 
 
277 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  36.84 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  28.31 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  39.62 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  29.25 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  28.23 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  27.96 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  23.74 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  37.96 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  25.7 
 
 
262 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  28.04 
 
 
252 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  28.4 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4880  hypothetical protein  30.86 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4969  hypothetical protein  30.86 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  26.18 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5248  hypothetical protein  30.86 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  33.64 
 
 
381 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  26.43 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  28.21 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  28.63 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  28.94 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2527  glutamine amidotransferase class-II  25.54 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.228426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  31.68 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0361  glutamine amidotransferase class-II  26.91 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0336883  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2921  glutamine amidotransferase, class-II  33.33 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0460423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0376  glutamine amidotransferase class-II  26.91 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154338  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  36.79 
 
 
261 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  36.79 
 
 
261 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  36.79 
 
 
261 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
479 aa  52.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  34.59 
 
 
243 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0461  glutamine amidotransferase, class-II  27.14 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  27.13 
 
 
269 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  28.62 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0234  glutamine amidotransferase, class-II  36.61 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127824  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0389  glutamine amidotransferase class-II  26.43 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0224  glutamine amidotransferase, class-II  36.61 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>