236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3769 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  579  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  79.64 
 
 		 275 aa  474  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  41.43 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  41.54 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  41.54 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  44.36 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  42.22 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  42.05 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  40.36 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  41.67 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  40.65 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  41.3 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  41.98 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  40.65 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  41.38 
 
 		 306 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  41.38 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  41.38 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  41.54 
 
 		 263 aa  215  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  41.29 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  40.51 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  40.6 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  40.15 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  39.93 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  40.77 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  40 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  40.6 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  39.54 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  43.02 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  41.22 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  38.24 
 
 		 340 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  40.54 
 
 		 275 aa  205  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  39.27 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  38.24 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  38.24 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  39.27 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  38.24 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  38.24 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  38.24 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  38.24 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  38.24 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  39.15 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  42.02 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  42.02 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  39.1 
 
 		 277 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  36.6 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  41.63 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  37.97 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  36.69 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  38.91 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  37.74 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  39.73 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  35.56 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  32.18 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  29.89 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  29.89 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  33.21 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  31.7 
 
 		 381 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  31.16 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  32.96 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  32.96 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  34.17 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  33.21 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  30.65 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  32.43 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37436  predicted protein  30.92 
 
 		 431 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.17911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  29.2 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33024  predicted protein  29.88 
 
 		 529 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102029  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02390  cytoplasm protein, putative  27.56 
 
 		 406 aa  95.9  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.20974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2778  hypothetical protein  26.71 
 
 		 305 aa  95.5  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2884  hypothetical protein  26.62 
 
 		 304 aa  95.5  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2649  hypothetical protein  25.08 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  35.85 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  30.4 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  29.52 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  29.52 
 
 		 257 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  34.32 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  26.71 
 
 		 248 aa  85.9  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1080  hypothetical protein  27.37 
 
 		 282 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  38.52 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  26.1 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0330  hypothetical protein  26.89 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  0.833255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  25.18 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  34.92 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  32.48 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2412  glutamine amidotransferase, class II  29.13 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  25.18 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7302  hypothetical protein  35.07 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2003  glutamine amidotransferase, class-II  31.17 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2649  hypothetical protein  26.2 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4078  glutamine amidotransferase class-II  26.25 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000156839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5315  glutamine amidotransferase class-II  25.94 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11079  hypothetical protein  34.55 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554222  normal  0.24783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  26.55 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  27.47 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1401  glutamine amidotransferase, class-II  28.51 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  28.63 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5170  glutamine amidotransferase class-II  32 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  28.44 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  28.63 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>