161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1778 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1778  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 295 aa  624  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0795845  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  34.49 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  34.49 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57929  Glucosamine 6-phosphate synthetase  33.88 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01092  glutamine amidotransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11980)  34.56 
 
 		 381 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  37.5 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  32.2 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  32.2 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  32.2 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  32.2 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  32.2 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  32.2 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  32.2 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02390  cytoplasm protein, putative  36.36 
 
 		 406 aa  145  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.20974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  33.83 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  31.82 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  31.82 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  30.58 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  31.42 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  31.82 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  34.41 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  30.8 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  30.8 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  30.96 
 
 		 277 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  29.59 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3187  glutamine amidotransferase class-II  32.97 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0734205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  30.77 
 
 		 277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3769  hypothetical protein  31.16 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  30.27 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6587  hypothetical protein  32.16 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2549  glutamine amidotransferase class-II  37.34 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2254  hypothetical protein  36.45 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0610184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  32.84 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37436  predicted protein  33.58 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.17911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0686  hypothetical protein  32.86 
 
 		 269 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3135  hypothetical protein  31.58 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  31.32 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5310  glutamine amidotransferase class-II  30.96 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2433  hypothetical protein  38.76 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00103961  normal  0.0961307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5354  glutamine amidotransferase class-II  29.87 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4869  glutamine amidotransferase class-II  29.87 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.399694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4279  hypothetical protein  31.43 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2379  glutamine amidotransferase class-II  36.32 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5411  glutamine amidotransferase class-II  30.67 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.71431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3036  hypothetical protein  29.15 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1757  hypothetical protein  31.73 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1742  hypothetical protein  30.22 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.429984  normal  0.334834 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1002  hypothetical protein  31.32 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33024  predicted protein  32.93 
 
 		 529 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4573  putative glutamine amidotransferase class-II (Gn-AT), YafJ-type  29.29 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497053  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4440  hypothetical protein  29.29 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4035  glutamine amidotransferase class-II  36.14 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.921516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  30.71 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3178  glutamine amidotransferase class-II  32.55 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2939  glutamine amidotransferase class-II  32.55 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  30.31 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4073  glutamine amidotransferase class-II  34.01 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  29.6 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3779  glutamine amidotransferase class-II  34.01 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  0.837896 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1234  glutamine amidotransferase, class-II  34.6 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  32.86 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  40.49 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  32.86 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0600  putative glutamine amidotransferase  32.86 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  35.05 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  33.18 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  29.71 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2778  hypothetical protein  28.47 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2649  hypothetical protein  28.47 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2474  hypothetical protein  30.19 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2124  glutamine amidotransferase-like protein  35.06 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0957142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  30.77 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2884  hypothetical protein  27.05 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  34.16 
 
 		 249 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4513  hypothetical protein  30.58 
 
 		 245 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.610304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7302  hypothetical protein  28.06 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3639  glutamine amidotransferase, class-II  36.23 
 
 		 243 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8030  hypothetical protein  29.11 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  28 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0639  glutamine amidotransferase, class-II  27.21 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.667502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22450  conserved hypothetical protein TIGR03442  37.82 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.862407  normal  0.375862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  27.75 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0330  hypothetical protein  27.4 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  0.833255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  27.96 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  27.75 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1903  glutamine amidotransferase class-II  34.59 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  27.27 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5170  glutamine amidotransferase class-II  27.23 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1080  hypothetical protein  29.17 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  24.83 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5275  glutamine amidotransferase class-II  30.32 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13733  hypothetical protein  32.79 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.405783  normal  0.721065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  27.36 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1360  glutamine amidotransferase, class-II  27.32 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1259  glutamine amidotransferase, class-II  27.32 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4880  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4969  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5248  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2589  glutamine amidotransferase, class-II  25.77 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2649  hypothetical protein  33.06 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>