27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1186 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1186  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0994  hypothetical protein  60.83 
 
 
219 aa  284  8e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.811741  normal  0.0118978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0846  hypothetical protein  61.64 
 
 
218 aa  278  6e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1856  hypothetical protein  55.91 
 
 
220 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0526188  normal  0.336481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2471  conserved hypothetical protein  35.79 
 
 
228 aa  105  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1080  glutamine amidotransferase-like protein  29.75 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1482  hypothetical protein  33.06 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.168622  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1174  glutamine amidotransferase, class II  30.77 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.640614 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1016  glutamine amidotransferase-like protein  26.94 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.42516 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0989  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.879839  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1610  glutamine amidotransferase-like protein  30.65 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0187  glutamine amidotransferase-like protein  31.75 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000164935  normal  0.0532768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0457  glutamine amidotransferase-like protein  31.68 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000211825 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1099  glutamine amidotransferase, class-II  32.04 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161791 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0143  glutamine amidotransferase-like protein  30.85 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0414  hypothetical protein  27.93 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2184  hypothetical protein  27.46 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.817401 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0171  glutamine amidotransferase-like protein  25.61 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
526 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  35.64 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
526 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2258  hypothetical protein  31.78 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.798881  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30050  predicted glutamine amidotransferase  24.04 
 
 
289 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2115  hypothetical protein  30.47 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0386875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  32.65 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1340  hypothetical protein  25.93 
 
 
275 aa  42  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4539  glutamine amidotransferase, class-II  26.11 
 
 
262 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>