209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0143 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0143  glutamine amidotransferase-like protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0457  glutamine amidotransferase-like protein  89.55 
 
 
220 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000211825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1610  glutamine amidotransferase-like protein  53.57 
 
 
223 aa  239  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1099  glutamine amidotransferase, class-II  54.13 
 
 
231 aa  227  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161791 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0171  glutamine amidotransferase-like protein  29.24 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1505  glutamine amidotransferase, class-II  29.39 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2362  glutamine amidotransferase class-II  29.67 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0251879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2450  glutamine amidotransferase class-II  28.98 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2319  glutamine amidotransferase class-II  29.44 
 
 
254 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.066188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4720  glutamine amidotransferase, class-II  25.1 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2568  glutamine amidotransferase class-II  26.69 
 
 
301 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181144  normal  0.107794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4623  glutamine amidotransferase class-II  27.38 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.753682  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2145  glutamine amidotransferase, class-II  25.78 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00200131  normal  0.701842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1186  hypothetical protein  30.85 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2281  hypothetical protein  31.87 
 
 
273 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.569375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4354  glutamine amidotransferase class-II  25.4 
 
 
270 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00773  glutamine amidotransferase class-II domain protein  27.38 
 
 
277 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2322  glutamine amidotransferase, class-II  26.17 
 
 
279 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000453875  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2107  glutamine amidotransferase, class-II  30.97 
 
 
261 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000050083  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2222  glutamine amidotransferase, class-II  25.68 
 
 
259 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00864391  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1265  glutamine amidotransferase class-II  29.69 
 
 
269 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2102  putative glutamine amidotransferase  28.3 
 
 
264 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0449  putative glutamine amidotransferase  28.3 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.896523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0160  glutamine amidotransferase, class-II  26.19 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.831783  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0160  glutamine amidotransferase class-II  24.81 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1323  YafJ  26.64 
 
 
340 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2535  amidotransferase  30.29 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2392  glutamine amidotransferase class-II  29.49 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2603  glutamine amidotransferase class-II  30.43 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  normal  0.664622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0846  hypothetical protein  33.91 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.557231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0403  glutamine amidotransferase, class-II  24.5 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.911525  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1856  hypothetical protein  34.21 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0526188  normal  0.336481 
 
 
-
 
NC_004310  BR1678  glutamine amidotransferase, putative  31.45 
 
 
287 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.429372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0676  glutamine amidotransferase class-II  27.75 
 
 
263 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1622  putative glutamine amidotransferase  31.45 
 
 
287 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.153053  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2311  yafJ protein, putative  26.26 
 
 
278 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0927874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3305  YafJ  26.26 
 
 
278 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3877  glutamine amidotransferase, class-II  27.78 
 
 
277 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2000  glutamine amidotransferase, class-II  30.57 
 
 
259 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  decreased coverage  0.000000243936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1765  glutamine amidotransferase, class-II  29.79 
 
 
258 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0517  putative glutamine amidotransferase  26.26 
 
 
278 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1082  putative glutamine amidotransferase  26.26 
 
 
278 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.897604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3260  putative glutamine amidotransferase  26.26 
 
 
278 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3294  putative glutamine amidotransferase  26.26 
 
 
278 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.462557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2189  putative glutamine amidotransferase  26.26 
 
 
278 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0330  hypothetical protein  28.07 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  0.833255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1389  glutamine amidotransferase, class-II  28.68 
 
 
260 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0766  glutamine amidotransferase, class-II  27.1 
 
 
298 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1080  glutamine amidotransferase-like protein  30.41 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3565  hypothetical protein  29.81 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0143883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0956  glutamine amidotransferase, class-II  22.96 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0665  glutamine amidotransferase, class-II  27.16 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1869  amidotransferase  30.32 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.120168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0341  glutamine amidotransferase, class II  25.79 
 
 
255 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.501793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3358  glutamine amidotransferase class-II  26.22 
 
 
311 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000750895  hitchhiker  0.00000227279 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2659  hypothetical protein  27.22 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2529  hypothetical protein  27.22 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0345  glutamine amidotransferase, class II  25.79 
 
 
255 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0601  putative glutatmine aminotransferase  26.22 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.142465  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0352  glutamine amidotransferase, class II  25.79 
 
 
255 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.363552  hitchhiker  0.000855059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5534  glutamine amidotransferase class-II  26.91 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335271  normal  0.0325621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0350  glutamine amidotransferase, class-II  25.79 
 
 
255 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.69007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0360  glutamine amidotransferase, class II  25.79 
 
 
255 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0719  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  28.22 
 
 
612 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.12268  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0688  glutamine amidotransferase class-II  27.16 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0994  hypothetical protein  33.06 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.811741  normal  0.0118978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0378  glutamine amidotransferase  27.95 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3628  putative glutamine amidotransferase  25.1 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.322393  normal  0.410732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2266  glutamine amidotransferase, class II  32.61 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0126993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0756  glutamine amidotransferase class-II  27.33 
 
 
306 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0304  glutamine amidotransferase, class-II  27.33 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0787  glutamine amidotransferase, class-II  27.33 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0940  hypothetical protein  24.33 
 
 
260 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.567722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2305  glutamine amidotransferase class-II  31.03 
 
 
259 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000953418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1792  glutamine amidotransferase, class-II  24.33 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00452611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7207  putative glutamine amidotransferase, class-II  30.07 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688449  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2318  glutamine amidotransferase class-II  31.03 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000450533  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2068  glutamine amidotransferase class-II  31.03 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0357451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1726  glutamine amidotransferase, class-II  33.04 
 
 
270 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2020  glutamine amidotransferase class-II  31.03 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000156319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002779  predicted glutamine amidotransferase  30.94 
 
 
281 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2375  glutamine amidotransferase, class-II  28.03 
 
 
260 aa  49.3  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1981  glutamine amidotransferase class-II  25.19 
 
 
257 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499253  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2370  glutamine amidotransferase-like protein  27.87 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2392  putative amidotransferase  33.04 
 
 
275 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1502  glutamine amidotransferase class-II  26.1 
 
 
263 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3384  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
304 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0951  glutamine amidotransferase class-II  30.71 
 
 
268 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2595  glutamine amidotransferase class-II  26.06 
 
 
277 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0948984  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2423  hypothetical protein  27.27 
 
 
304 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3426  hypothetical protein  27.27 
 
 
316 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000096864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1229  glutamine amidotransferases class-II domain-containing protein  26.89 
 
 
327 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1298  hypothetical protein  29.45 
 
 
277 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
519 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2709  glutamine amidotransferase class-II  25.76 
 
 
328 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0635  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.38 
 
 
601 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0340  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
304 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1201  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
304 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3419  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
304 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2611  class-II glutamine amidotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
304 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>