20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1856 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1856  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0526188  normal  0.336481 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0994  hypothetical protein  60.45 
 
 
219 aa  281  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.811741  normal  0.0118978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1186  hypothetical protein  55.91 
 
 
219 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0846  hypothetical protein  59.55 
 
 
218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.557231 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2471  conserved hypothetical protein  32.89 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494211  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1482  hypothetical protein  33.73 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.168622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1080  glutamine amidotransferase-like protein  30.61 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1016  glutamine amidotransferase-like protein  28.63 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.42516 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0989  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.879839  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1174  glutamine amidotransferase, class II  27.57 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.640614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1610  glutamine amidotransferase-like protein  31.93 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0457  glutamine amidotransferase-like protein  35.96 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000211825 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0143  glutamine amidotransferase-like protein  34.21 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0187  glutamine amidotransferase-like protein  28.81 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000164935  normal  0.0532768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0203  hypothetical protein  32.23 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0171  glutamine amidotransferase-like protein  30.25 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264215  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1099  glutamine amidotransferase, class-II  30.58 
 
 
231 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.161791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1317  hypothetical protein  31.51 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5484  hypothetical protein  29.45 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  0.0812998 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0414  hypothetical protein  26.01 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>