More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5087 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5087  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5189  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3178  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 354 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5080  LysR family transcriptional regulator  62 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5197  LysR family transcriptional regulator  62 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.093521  decreased coverage  0.00215851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3171  LysR family transcriptional regulator  62 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 334 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 334 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 334 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  38.49 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  37.8 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 324 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 300 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 297 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 428 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.49 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4543  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110583  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 298 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0754  LysR substrate-binding  35.45 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  32.2 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5132  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.052958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1052  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3814  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.412952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3707  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381625  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4656  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2231  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  32.53 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>