More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5189 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3178  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 354 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5087  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5189  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5197  LysR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.093521  decreased coverage  0.00215851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3171  LysR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5080  LysR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  36.47 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  37.69 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 334 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  36.92 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  36.92 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  36.12 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 322 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  36.57 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 305 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 305 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.34 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  32.96 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0754  LysR substrate-binding  35.88 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5132  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.052958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  33.97 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4543  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110583  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0994  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  32.71 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 428 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1052  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 435 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  33.07 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.71 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.866328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  33.07 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1655  regulatory protein LysR:LysR, substrate-binding  30.71 
 
 		 301 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2231  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1802  regulatory protein LysR:LysR, substrate-binding  30.34 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.450792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>