More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6629 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6227  dihydroxy-acid dehydratase  99.3 
 
 		 571 aa  1142    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.974759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6396  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 571 aa  1149    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3211  Dihydroxy-acid dehydratase  73.47 
 
 		 565 aa  815    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6629  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 571 aa  1149    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5894  dihydroxyacid dehydratase  54.08 
 
 		 561 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2585  Dihydroxy-acid dehydratase  51.34 
 
 		 559 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4523  dihydroxy-acid dehydratase  51.95 
 
 		 562 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5111  dihydroxyacid dehydratase  51.62 
 
 		 560 aa  544  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.679099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3651  dihydroxyacid dehydratase  51.17 
 
 		 567 aa  524  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.583324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  37.86 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  38.78 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  36.8 
 
 		 554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  38.45 
 
 		 552 aa  356  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  36.87 
 
 		 557 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  36.51 
 
 		 557 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  38.49 
 
 		 557 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  36.51 
 
 		 557 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  36.51 
 
 		 557 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  36.51 
 
 		 557 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  36.33 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  36.69 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  36.33 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  36.15 
 
 		 557 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  37.88 
 
 		 563 aa  349  8e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  37.95 
 
 		 554 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  36.33 
 
 		 557 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  36.15 
 
 		 557 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  38.58 
 
 		 553 aa  346  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  37.59 
 
 		 552 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  37.14 
 
 		 559 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  38.28 
 
 		 557 aa  344  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  41.14 
 
 		 563 aa  343  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  36.9 
 
 		 558 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  38.02 
 
 		 554 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  36.46 
 
 		 554 aa  342  9e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  35.82 
 
 		 553 aa  342  9e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  36.28 
 
 		 554 aa  340  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  36.76 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  38.31 
 
 		 548 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  35.56 
 
 		 552 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  39.63 
 
 		 559 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1850  Dihydroxy-acid dehydratase  36.88 
 
 		 547 aa  333  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0203802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  39.45 
 
 		 559 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  38.89 
 
 		 561 aa  331  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  34.93 
 
 		 556 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  38.01 
 
 		 555 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  38.39 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  38.86 
 
 		 569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  37.13 
 
 		 558 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  37.38 
 
 		 552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  37.83 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  38.84 
 
 		 547 aa  327  5e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  38.09 
 
 		 565 aa  326  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  38.25 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  35.85 
 
 		 550 aa  325  2e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  36.74 
 
 		 556 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  36.74 
 
 		 556 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  39.02 
 
 		 547 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  36.95 
 
 		 579 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  37.52 
 
 		 554 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  37.71 
 
 		 560 aa  321  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  36.91 
 
 		 561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  36.09 
 
 		 561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  37.45 
 
 		 557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5915  dihydroxy-acid dehydratase  36.48 
 
 		 569 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  36.51 
 
 		 563 aa  320  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  37.52 
 
 		 559 aa  320  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  36.79 
 
 		 565 aa  320  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2151  dihydroxy-acid dehydratase  37.08 
 
 		 561 aa  319  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.950442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  37.04 
 
 		 564 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  36.3 
 
 		 557 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  37.83 
 
 		 571 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  36.41 
 
 		 580 aa  317  3e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  37.19 
 
 		 553 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  37.21 
 
 		 557 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  35.05 
 
 		 558 aa  317  5e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  36.89 
 
 		 557 aa  316  6e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  34.16 
 
 		 558 aa  316  7e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  37 
 
 		 557 aa  316  7e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2863  dihydroxy-acid dehydratase  37.66 
 
 		 557 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0663507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  36.14 
 
 		 562 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  36.64 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  35.87 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  36.14 
 
 		 562 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  37.08 
 
 		 557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  37.61 
 
 		 557 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  36.89 
 
 		 566 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  35.59 
 
 		 562 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  35.06 
 
 		 557 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  38.15 
 
 		 556 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0708  dihydroxy-acid dehydratase  36.45 
 
 		 570 aa  313  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156931 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  34.52 
 
 		 558 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  35.93 
 
 		 547 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  35.05 
 
 		 550 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  36.97 
 
 		 564 aa  312  9e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  36.97 
 
 		 564 aa  312  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  37.31 
 
 		 571 aa  312  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  36.4 
 
 		 567 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  38.19 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  38.35 
 
 		 557 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>