More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2585 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2585  Dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 559 aa  1135    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3651  dihydroxyacid dehydratase  66.73 
 
 		 567 aa  748    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.583324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4523  dihydroxy-acid dehydratase  52.85 
 
 		 562 aa  594  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5894  dihydroxyacid dehydratase  51.54 
 
 		 561 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5111  dihydroxyacid dehydratase  51.44 
 
 		 560 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.679099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6396  dihydroxy-acid dehydratase  51.34 
 
 		 571 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6629  dihydroxy-acid dehydratase  51.34 
 
 		 571 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6227  dihydroxy-acid dehydratase  51.16 
 
 		 571 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.974759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3211  Dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 		 565 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  39.71 
 
 		 557 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  41.23 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  40.04 
 
 		 558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  39.82 
 
 		 558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  40.79 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  38.99 
 
 		 556 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  40.11 
 
 		 559 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  39.39 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  39.17 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  39.17 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  39.35 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  39.17 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  39.17 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  39.17 
 
 		 557 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  39.35 
 
 		 557 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  41.54 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  39.14 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  39.35 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  38.81 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  38.99 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  38.99 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  39.32 
 
 		 552 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  38.77 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  39.68 
 
 		 553 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  38.77 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  39.93 
 
 		 548 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  38.55 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  37.73 
 
 		 553 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  39.96 
 
 		 559 aa  388  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  38.22 
 
 		 554 aa  389  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  39.64 
 
 		 566 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  40.33 
 
 		 567 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  39.42 
 
 		 550 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  39.5 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  40.18 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  39.59 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  38.24 
 
 		 565 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  38.66 
 
 		 554 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  37.5 
 
 		 552 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  39.63 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  41.61 
 
 		 563 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  37.82 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  39.63 
 
 		 559 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  39.78 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  37.64 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  39.5 
 
 		 565 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  38.09 
 
 		 557 aa  373  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  37.16 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  38.93 
 
 		 563 aa  365  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  38.24 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  37.66 
 
 		 573 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  39.66 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  38.79 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  39.2 
 
 		 547 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  37.29 
 
 		 572 aa  369  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  39.27 
 
 		 570 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  38.19 
 
 		 558 aa  365  1e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  39.59 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  39.13 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  38.28 
 
 		 557 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  37.98 
 
 		 570 aa  364  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0708  dihydroxy-acid dehydratase  38.31 
 
 		 570 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  40.04 
 
 		 553 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  39.85 
 
 		 553 aa  362  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  38.22 
 
 		 554 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  38.57 
 
 		 580 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  38.57 
 
 		 580 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  38.53 
 
 		 589 aa  360  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  38.57 
 
 		 580 aa  360  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  38.18 
 
 		 550 aa  359  6e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  37.84 
 
 		 555 aa  359  9e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  38.39 
 
 		 555 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  37.84 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  38.1 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  37.02 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  37.36 
 
 		 571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  38.32 
 
 		 575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  36.76 
 
 		 554 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  37.89 
 
 		 547 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  37.22 
 
 		 576 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  38.5 
 
 		 565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  35.8 
 
 		 555 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  38.67 
 
 		 563 aa  356  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  37.36 
 
 		 559 aa  356  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  37.18 
 
 		 559 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  35.99 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  36.76 
 
 		 555 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  35.73 
 
 		 580 aa  355  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  38.14 
 
 		 567 aa  354  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  37.75 
 
 		 553 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  37.45 
 
 		 579 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>