More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0673 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  69.98 
 
 		 553 aa  781    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  68.66 
 
 		 553 aa  770    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 548 aa  1095    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  60.43 
 
 		 557 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  57.48 
 
 		 550 aa  635    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  57.19 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  57.19 
 
 		 554 aa  628  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  58.63 
 
 		 552 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  55.22 
 
 		 552 aa  626  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  56.94 
 
 		 550 aa  627  1e-178  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  57.01 
 
 		 554 aa  627  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  56.32 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  55.76 
 
 		 553 aa  624  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  55.54 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  57.45 
 
 		 556 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  57.3 
 
 		 550 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  57.91 
 
 		 554 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  57.3 
 
 		 550 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  57.3 
 
 		 550 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  57.35 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  55.94 
 
 		 558 aa  609  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  57.55 
 
 		 556 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  55.68 
 
 		 552 aa  602  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  55.68 
 
 		 556 aa  602  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  56.14 
 
 		 547 aa  600  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  55.4 
 
 		 555 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  57.19 
 
 		 550 aa  595  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  55.91 
 
 		 557 aa  597  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  55.6 
 
 		 547 aa  594  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  57.48 
 
 		 553 aa  590  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  55.14 
 
 		 554 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  55.78 
 
 		 553 aa  588  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  55.48 
 
 		 551 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  55.2 
 
 		 560 aa  587  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  55.98 
 
 		 547 aa  585  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  54.33 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  54.94 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  54.51 
 
 		 553 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  54.77 
 
 		 556 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  56.14 
 
 		 556 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  52.76 
 
 		 565 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  56.58 
 
 		 559 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  54.04 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  53.15 
 
 		 554 aa  577  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  54.69 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  51.87 
 
 		 555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  52.94 
 
 		 565 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  54.37 
 
 		 569 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  52.4 
 
 		 566 aa  568  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  52.05 
 
 		 555 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  52.15 
 
 		 555 aa  568  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  52.53 
 
 		 552 aa  567  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  52.58 
 
 		 559 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  54.51 
 
 		 550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  51.96 
 
 		 558 aa  554  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  51.44 
 
 		 552 aa  554  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2747  dihydroxy-acid dehydratase  53.25 
 
 		 553 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  52.14 
 
 		 559 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  51.33 
 
 		 565 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1494  dihydroxy-acid dehydratase  53.07 
 
 		 553 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  51.34 
 
 		 558 aa  545  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  51.79 
 
 		 560 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  51.52 
 
 		 565 aa  544  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 557 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 557 aa  541  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 		 557 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  52.58 
 
 		 563 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 		 579 aa  537  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  52.05 
 
 		 579 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 		 567 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  49.56 
 
 		 561 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 		 557 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 		 558 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  49.73 
 
 		 582 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  49.29 
 
 		 613 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  49.29 
 
 		 558 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 		 575 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 557 aa  505  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  47.3 
 
 		 572 aa  501  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 575 aa  501  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  48.12 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  47.49 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 		 567 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  48.53 
 
 		 576 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  47.58 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  47.85 
 
 		 580 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  48.75 
 
 		 575 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  47.85 
 
 		 580 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 589 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 		 573 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>