More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4450 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  57.5 
 
 
562 aa  658    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  62.32 
 
 
557 aa  706    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  61.43 
 
 
558 aa  721    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  62.14 
 
 
557 aa  706    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  55.52 
 
 
560 aa  636    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  62.14 
 
 
557 aa  706    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  61.96 
 
 
557 aa  705    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  62.14 
 
 
557 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  55.87 
 
 
560 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  61.72 
 
 
559 aa  713    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  60.11 
 
 
569 aa  684    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  62.14 
 
 
557 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
561 aa  1151    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  58.21 
 
 
565 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  57.96 
 
 
559 aa  666    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  62.14 
 
 
557 aa  706    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  56.66 
 
 
561 aa  662    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  62.14 
 
 
557 aa  706    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  56.58 
 
 
561 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  61.61 
 
 
557 aa  701    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  56.58 
 
 
560 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  60.29 
 
 
557 aa  691    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  56.68 
 
 
554 aa  648    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  58.39 
 
 
562 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  62.32 
 
 
557 aa  706    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  60.11 
 
 
613 aa  686    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  56.96 
 
 
579 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  61.96 
 
 
557 aa  705    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  58.75 
 
 
566 aa  686    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  58.21 
 
 
565 aa  672    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  55.69 
 
 
559 aa  636    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  56.43 
 
 
580 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  56.96 
 
 
558 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  58.57 
 
 
565 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  57.78 
 
 
557 aa  678    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  59.46 
 
 
565 aa  681    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  58.39 
 
 
562 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  60.11 
 
 
558 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  55.16 
 
 
558 aa  634  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  56.41 
 
 
553 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  56.86 
 
 
577 aa  625  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  53.38 
 
 
558 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  52.21 
 
 
562 aa  618  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  53.56 
 
 
558 aa  618  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  54.43 
 
 
582 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  53.38 
 
 
558 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  54 
 
 
557 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  54.19 
 
 
552 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  52.68 
 
 
558 aa  599  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  54.43 
 
 
557 aa  598  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
552 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  53.93 
 
 
553 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  50.71 
 
 
554 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  52.87 
 
 
554 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  52.59 
 
 
556 aa  586  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  51.78 
 
 
557 aa  581  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  52.04 
 
 
555 aa  578  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  52.31 
 
 
555 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 
559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  52.4 
 
 
555 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  52.04 
 
 
555 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  51.96 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  51.16 
 
 
557 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  51.7 
 
 
556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  52.86 
 
 
551 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
550 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  50.53 
 
 
553 aa  557  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  50.66 
 
 
612 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  51.79 
 
 
557 aa  557  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  48.75 
 
 
553 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 
554 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1382  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
634 aa  553  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  hitchhiker  0.0000362711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  48.4 
 
 
553 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  47.54 
 
 
616 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  50.62 
 
 
579 aa  550  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  47.54 
 
 
616 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  52.14 
 
 
557 aa  550  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0141  dihydroxy-acid dehydratase  48.03 
 
 
616 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 
553 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
552 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0485  dihydroxy-acid dehydratase  47.54 
 
 
616 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.543148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 
556 aa  551  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0346  dihydroxy-acid dehydratase  48.11 
 
 
612 aa  551  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  51.25 
 
 
554 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  49.67 
 
 
612 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03649  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
616 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000570599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5205  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
616 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03598  hypothetical protein  47.38 
 
 
616 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000482952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  48.22 
 
 
553 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4149  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
616 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4129  dihydroxy-acid dehydratase  47.54 
 
 
616 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4294  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
616 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  50.89 
 
 
555 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3988  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
616 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
616 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
616 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  47.54 
 
 
616 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4235  dihydroxy-acid dehydratase  47.54 
 
 
616 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.866608  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  47.38 
 
 
616 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3773  dihydroxy-acid dehydratase  47.87 
 
 
616 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>