More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0633 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  95.45 
 
 
550 aa  1045    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  78.55 
 
 
550 aa  906    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  56.83 
 
 
553 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  95.45 
 
 
550 aa  1044    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  89.45 
 
 
550 aa  1014    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
550 aa  1110    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  57.69 
 
 
554 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  57.32 
 
 
552 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  57.14 
 
 
553 aa  630  1e-179  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  57.3 
 
 
548 aa  625  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  57.12 
 
 
547 aa  620  1e-176  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  55.35 
 
 
554 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  55.33 
 
 
552 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  55.15 
 
 
552 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  56.36 
 
 
550 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  54.59 
 
 
558 aa  612  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  54.97 
 
 
553 aa  609  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  56.78 
 
 
551 aa  611  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  54.17 
 
 
547 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  55.54 
 
 
556 aa  606  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  54.36 
 
 
547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  56.33 
 
 
565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  54.84 
 
 
565 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  54.94 
 
 
557 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  57.5 
 
 
559 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  54.56 
 
 
566 aa  598  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  53.45 
 
 
553 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  55.3 
 
 
559 aa  596  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  53.72 
 
 
552 aa  597  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  53.82 
 
 
550 aa  593  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  54.05 
 
 
555 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  53.45 
 
 
553 aa  593  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  53.16 
 
 
556 aa  591  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  53.09 
 
 
553 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  53.99 
 
 
554 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  53.45 
 
 
553 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  52.63 
 
 
553 aa  586  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  54.17 
 
 
553 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  53.87 
 
 
555 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  53.33 
 
 
555 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  52.44 
 
 
558 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  52.8 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  54.56 
 
 
565 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  52.18 
 
 
556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 
559 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  53.65 
 
 
579 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  51.9 
 
 
554 aa  570  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  52.99 
 
 
560 aa  568  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
554 aa  568  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  51.9 
 
 
554 aa  571  1e-161  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1494  dihydroxy-acid dehydratase  52.73 
 
 
553 aa  568  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  51.81 
 
 
556 aa  568  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  54.03 
 
 
565 aa  565  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2747  dihydroxy-acid dehydratase  52.91 
 
 
553 aa  568  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  51.34 
 
 
563 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 
557 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  51.27 
 
 
554 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 
557 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 
557 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 
557 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 
557 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  50.18 
 
 
552 aa  558  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
555 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 
557 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 
557 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 
557 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 
557 aa  558  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 
557 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  51.97 
 
 
557 aa  555  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
557 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
555 aa  553  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  51.54 
 
 
557 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
560 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
569 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  48.84 
 
 
561 aa  545  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
556 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  49.02 
 
 
580 aa  541  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
579 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 
562 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 
562 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  48.56 
 
 
557 aa  535  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 
557 aa  531  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 
562 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  48.84 
 
 
613 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  48.84 
 
 
558 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  47.4 
 
 
558 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
553 aa  511  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 
558 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  47.27 
 
 
577 aa  509  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  47.12 
 
 
558 aa  507  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  48.1 
 
 
557 aa  506  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  47.05 
 
 
561 aa  499  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  47.76 
 
 
558 aa  501  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  47.58 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  46.71 
 
 
560 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 
560 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  47.24 
 
 
562 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  46.71 
 
 
560 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  46.95 
 
 
559 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  46.42 
 
 
566 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>