More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3218 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  57.32 
 
 
558 aa  660    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  58.87 
 
 
554 aa  661    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  58.39 
 
 
557 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  69.95 
 
 
558 aa  809    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  66.79 
 
 
561 aa  758    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  58.5 
 
 
557 aa  678    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  58.32 
 
 
557 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  58.21 
 
 
557 aa  676    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  58.32 
 
 
557 aa  678    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  70.48 
 
 
558 aa  811    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  61.39 
 
 
613 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  58.68 
 
 
557 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
562 aa  1145    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  57.78 
 
 
557 aa  673    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  58.32 
 
 
557 aa  676    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  58.5 
 
 
557 aa  678    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  71.23 
 
 
561 aa  829    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  57.07 
 
 
559 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  68.09 
 
 
560 aa  765    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  74.29 
 
 
557 aa  840    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  68.87 
 
 
558 aa  796    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  58.39 
 
 
557 aa  679    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  74.11 
 
 
582 aa  846    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  76.91 
 
 
559 aa  894    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  68.26 
 
 
560 aa  764    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  67.73 
 
 
560 aa  760    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  58.32 
 
 
557 aa  677    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  58.9 
 
 
557 aa  674    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  58.39 
 
 
558 aa  660    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  69.11 
 
 
557 aa  781    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  68.69 
 
 
553 aa  768    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  57.02 
 
 
565 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  57.12 
 
 
565 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  61.39 
 
 
558 aa  689    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  53.56 
 
 
557 aa  635    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  70.3 
 
 
558 aa  793    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  55.87 
 
 
565 aa  627  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  54.9 
 
 
559 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  54.63 
 
 
566 aa  618  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  52.21 
 
 
561 aa  618  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  55.34 
 
 
579 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  54.88 
 
 
565 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  53.02 
 
 
562 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  53.2 
 
 
569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  52.85 
 
 
562 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  52.85 
 
 
562 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  52.77 
 
 
577 aa  585  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  51.42 
 
 
580 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  51.79 
 
 
554 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  52.14 
 
 
558 aa  561  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  50.89 
 
 
552 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  51.69 
 
 
555 aa  551  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  51.33 
 
 
555 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  51.25 
 
 
554 aa  549  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  51.87 
 
 
555 aa  550  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 
559 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  52.32 
 
 
556 aa  548  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  49.38 
 
 
563 aa  537  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
557 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
552 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  48.22 
 
 
555 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  49.56 
 
 
557 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  51.43 
 
 
552 aa  529  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  49.47 
 
 
552 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  47.85 
 
 
612 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  47.12 
 
 
599 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1344  dihydroxy-acid dehydratase  48.06 
 
 
618 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002038  dihydroxy-acid dehydratase  46.19 
 
 
613 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  46.9 
 
 
556 aa  522  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
554 aa  524  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2305  dihydroxy-acid dehydratase  46.48 
 
 
619 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270143  hitchhiker  0.0000000364232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  46.61 
 
 
612 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 
554 aa  521  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3508  dihydroxy-acid dehydratase  46.19 
 
 
616 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2694  dihydroxy-acid dehydratase  46.48 
 
 
619 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1648  dihydroxy-acid dehydratase  45.74 
 
 
618 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0418  dihydroxyacid dehydratase  45.87 
 
 
617 aa  521  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0213625  decreased coverage  0.00250401 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  49.02 
 
 
560 aa  519  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  47.77 
 
 
554 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1304  dihydroxy-acid dehydratase  45.12 
 
 
628 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  46.94 
 
 
616 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 
551 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  46.94 
 
 
616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0485  dihydroxy-acid dehydratase  46.94 
 
 
616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.543148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2423  dihydroxy-acid dehydratase  48.42 
 
 
611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.421855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  45.86 
 
 
618 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4029  dihydroxy-acid dehydratase  45.87 
 
 
616 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2432  dihydroxy-acid dehydratase  45.02 
 
 
619 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1899  dihydroxy-acid dehydratase  45.64 
 
 
619 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18498  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3773  dihydroxy-acid dehydratase  46.19 
 
 
616 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125005  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  45.57 
 
 
619 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0988  dihydroxy-acid dehydratase  45.86 
 
 
618 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1074  dihydroxy-acid dehydratase  44.37 
 
 
636 aa  512  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.413782 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4231  dihydroxy-acid dehydratase  45.47 
 
 
619 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1046  dihydroxy-acid dehydratase  46.13 
 
 
617 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1838  dihydroxyacid dehydratase  45.84 
 
 
621 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  45.27 
 
 
613 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  45.24 
 
 
619 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.189174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1361  dihydroxy-acid dehydratase  45.72 
 
 
612 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0137226  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>