More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0012 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  57.73 
 
 
559 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  59.17 
 
 
557 aa  693    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  59.17 
 
 
557 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  59.5 
 
 
554 aa  669    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  76.44 
 
 
558 aa  888    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  67.86 
 
 
561 aa  766    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  59.17 
 
 
557 aa  692    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  58.99 
 
 
557 aa  690    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  58.81 
 
 
557 aa  687    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  69.35 
 
 
560 aa  771    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  60.43 
 
 
558 aa  685    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  76.26 
 
 
558 aa  887    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  58.99 
 
 
557 aa  689    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  74.11 
 
 
562 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  91.92 
 
 
557 aa  1031    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  56.45 
 
 
559 aa  636    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  58.99 
 
 
557 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  58.81 
 
 
557 aa  689    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  59.17 
 
 
557 aa  692    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  69.41 
 
 
561 aa  812    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  59.86 
 
 
613 aa  693    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  69.35 
 
 
560 aa  774    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  55.04 
 
 
557 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  58.17 
 
 
558 aa  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  57.07 
 
 
565 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  59.86 
 
 
558 aa  693    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  57.42 
 
 
565 aa  642    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  79.17 
 
 
553 aa  894    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  59.35 
 
 
557 aa  693    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
582 aa  1185    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  75 
 
 
558 aa  875    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  80.79 
 
 
557 aa  915    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  57.07 
 
 
565 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  58.81 
 
 
557 aa  688    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  78.6 
 
 
559 aa  922    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  76.26 
 
 
558 aa  868    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  69.53 
 
 
560 aa  773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  60.04 
 
 
557 aa  679    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  54.43 
 
 
561 aa  628  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  55.99 
 
 
566 aa  630  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  57.5 
 
 
579 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  54.48 
 
 
569 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  56.53 
 
 
565 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  53.67 
 
 
562 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  53.13 
 
 
562 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  53.13 
 
 
562 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  50.78 
 
 
580 aa  577  1.0000000000000001e-163  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  52.17 
 
 
577 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
552 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 
554 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
558 aa  549  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
554 aa  548  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3508  dihydroxy-acid dehydratase  47.86 
 
 
616 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  47.69 
 
 
612 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 
556 aa  543  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  49.19 
 
 
552 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  52.6 
 
 
559 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
552 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0418  dihydroxyacid dehydratase  47.54 
 
 
617 aa  539  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0213625  decreased coverage  0.00250401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
554 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 
552 aa  537  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5057  dihydroxy-acid dehydratase  47.62 
 
 
615 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0469  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 
615 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  47.88 
 
 
599 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2730  dihydroxyacid dehydratase  47.29 
 
 
925 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.73004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0348  dihydroxy-acid dehydratase  47.45 
 
 
615 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 
555 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0626  dihydroxy-acid dehydratase  48.45 
 
 
619 aa  538  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546913  normal  0.890987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  49.03 
 
 
560 aa  536  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  46.96 
 
 
619 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
554 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2486  dihydroxy-acid dehydratase  47.53 
 
 
614 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274808  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3279  dihydroxy-acid dehydratase  47.95 
 
 
618 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
555 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5358  dihydroxy-acid dehydratase  46.95 
 
 
613 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4012  dihydroxy-acid dehydratase  47.03 
 
 
616 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0988  dihydroxy-acid dehydratase  47.15 
 
 
618 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002038  dihydroxy-acid dehydratase  47.1 
 
 
613 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  47.15 
 
 
618 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4114  dihydroxy-acid dehydratase  47.03 
 
 
616 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0599  dihydroxy-acid dehydratase  47.22 
 
 
617 aa  531  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0151535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  46.6 
 
 
613 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0445  dihydroxy-acid dehydratase  49.06 
 
 
616 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  46.86 
 
 
616 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1648  dihydroxy-acid dehydratase  47.13 
 
 
618 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  47.36 
 
 
616 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4235  dihydroxy-acid dehydratase  47.19 
 
 
616 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.866608  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4294  dihydroxy-acid dehydratase  47.03 
 
 
616 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04630  dihydroxy-acid dehydratase  46.95 
 
 
612 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 
557 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4129  dihydroxy-acid dehydratase  47.19 
 
 
616 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  46.95 
 
 
612 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  46.89 
 
 
619 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.189174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4205  dihydroxy-acid dehydratase  46.7 
 
 
616 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00333285  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0340  dihydroxy-acid dehydratase  46.32 
 
 
616 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  46.38 
 
 
616 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  46.7 
 
 
616 aa  527  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3612  dihydroxy-acid dehydratase  47.21 
 
 
619 aa  527  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  46.38 
 
 
616 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>