More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2040 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  70.82 
 
 
562 aa  852    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  59.89 
 
 
557 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  59.71 
 
 
557 aa  696    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  59.89 
 
 
557 aa  696    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  59.71 
 
 
557 aa  698    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  66.49 
 
 
557 aa  789    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  59.89 
 
 
557 aa  700    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  56.04 
 
 
557 aa  649    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  57.81 
 
 
565 aa  673    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  56.73 
 
 
565 aa  647    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  56.65 
 
 
559 aa  666    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  59.71 
 
 
557 aa  696    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  56.73 
 
 
565 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  59.53 
 
 
557 aa  694    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  61.15 
 
 
558 aa  720    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  71.53 
 
 
562 aa  854    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  59.71 
 
 
557 aa  693    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  71.53 
 
 
562 aa  854    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  55.81 
 
 
579 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  61.54 
 
 
559 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  56.55 
 
 
566 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  59.71 
 
 
557 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  100 
 
 
580 aa  1194    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  68.58 
 
 
577 aa  805    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  56.55 
 
 
565 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  59.71 
 
 
557 aa  700    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  56.43 
 
 
561 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  60.25 
 
 
557 aa  701    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  55.32 
 
 
554 aa  629  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  55.1 
 
 
558 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  55.1 
 
 
613 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  52.96 
 
 
558 aa  613  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  55.1 
 
 
559 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  53.41 
 
 
558 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  52.96 
 
 
569 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  53.93 
 
 
561 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  55.61 
 
 
560 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 
558 aa  600  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  54.66 
 
 
561 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  55.26 
 
 
560 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  53.05 
 
 
558 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  53.06 
 
 
552 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  55.08 
 
 
560 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  52.7 
 
 
554 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  54.68 
 
 
559 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 
553 aa  587  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 
552 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 
558 aa  587  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 
558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  51.42 
 
 
562 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  51.26 
 
 
552 aa  581  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
553 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  51.61 
 
 
556 aa  575  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  51.88 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  51.88 
 
 
555 aa  571  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  51.16 
 
 
557 aa  568  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  51.52 
 
 
555 aa  568  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 
554 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  50.78 
 
 
582 aa  566  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  51.34 
 
 
555 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  50.53 
 
 
560 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 
557 aa  565  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 
552 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 
555 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
551 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  51.26 
 
 
557 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  48.51 
 
 
563 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 
556 aa  547  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
560 aa  542  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  48.93 
 
 
612 aa  542  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  48.6 
 
 
612 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
557 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 
554 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 
555 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 
556 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  48.92 
 
 
554 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 
554 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  48.48 
 
 
550 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  47.41 
 
 
550 aa  531  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  49.02 
 
 
550 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1344  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 
618 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122991  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  47.95 
 
 
553 aa  525  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  48.12 
 
 
550 aa  527  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  47.41 
 
 
550 aa  527  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  50 
 
 
552 aa  522  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1382  dihydroxy-acid dehydratase  45.79 
 
 
634 aa  525  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.469767  hitchhiker  0.0000362711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  46.49 
 
 
553 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  46.76 
 
 
553 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  46.3 
 
 
599 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  47.94 
 
 
557 aa  518  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4205  dihydroxy-acid dehydratase  46.46 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00333285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5205  dihydroxy-acid dehydratase  46.46 
 
 
616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4129  dihydroxy-acid dehydratase  46.13 
 
 
616 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4294  dihydroxy-acid dehydratase  46.13 
 
 
616 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03598  hypothetical protein  46.46 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000482952  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4149  dihydroxy-acid dehydratase  46.46 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  46.29 
 
 
616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  46.46 
 
 
616 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>