More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0742 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  57.93 
 
 		 555 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  57.96 
 
 		 560 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  58.14 
 
 		 562 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  64.53 
 
 		 557 aa  743    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  58.6 
 
 		 558 aa  653    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  59.29 
 
 		 558 aa  665    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  64.71 
 
 		 557 aa  744    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  64.35 
 
 		 557 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  64.17 
 
 		 557 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  64.53 
 
 		 557 aa  740    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  62.54 
 
 		 557 aa  704    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  64.99 
 
 		 558 aa  753    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  59.96 
 
 		 552 aa  675    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  64.17 
 
 		 557 aa  740    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  60.18 
 
 		 559 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  58.32 
 
 		 561 aa  654    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  83.57 
 
 		 566 aa  975    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  58.29 
 
 		 555 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  64.17 
 
 		 557 aa  738    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  64.35 
 
 		 557 aa  741    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  86.37 
 
 		 565 aa  972    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  87.05 
 
 		 559 aa  994    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  59.29 
 
 		 613 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  64.35 
 
 		 557 aa  740    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  56.61 
 
 		 561 aa  649    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  58.56 
 
 		 554 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 565 aa  1144    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  57.99 
 
 		 552 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  58.5 
 
 		 560 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  64.27 
 
 		 557 aa  735    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  57.86 
 
 		 557 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  59.46 
 
 		 561 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  81.4 
 
 		 579 aa  924    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  57.42 
 
 		 559 aa  642    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  57.96 
 
 		 560 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  59.21 
 
 		 562 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  64.63 
 
 		 559 aa  739    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  59.89 
 
 		 554 aa  688    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  87.26 
 
 		 565 aa  1011    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  58.6 
 
 		 558 aa  671    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  59.21 
 
 		 562 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  57.81 
 
 		 580 aa  673    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  56.51 
 
 		 577 aa  652    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  58.29 
 
 		 555 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  64.35 
 
 		 557 aa  741    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  86.02 
 
 		 565 aa  990    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  60.68 
 
 		 569 aa  701    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  57.27 
 
 		 552 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  58.99 
 
 		 557 aa  682    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  58.78 
 
 		 554 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  56.99 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  55.87 
 
 		 562 aa  627  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  56.27 
 
 		 553 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  57.42 
 
 		 582 aa  626  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  57.07 
 
 		 557 aa  623  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  56.29 
 
 		 553 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  56.65 
 
 		 556 aa  617  1e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  55.73 
 
 		 558 aa  615  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  57.53 
 
 		 553 aa  617  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  56.37 
 
 		 551 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  56.65 
 
 		 554 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  55 
 
 		 555 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  55.4 
 
 		 554 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  54.38 
 
 		 554 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  55.81 
 
 		 557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  54.12 
 
 		 558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  53.94 
 
 		 558 aa  601  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  54.41 
 
 		 552 aa  601  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  53.67 
 
 		 556 aa  598  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  54.2 
 
 		 554 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  55.38 
 
 		 556 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  54.64 
 
 		 555 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  55.99 
 
 		 557 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  56.33 
 
 		 550 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  56.09 
 
 		 550 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  56.09 
 
 		 550 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  54.12 
 
 		 558 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  51.96 
 
 		 553 aa  578  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  52.74 
 
 		 563 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  54.12 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  53.24 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  53.49 
 
 		 560 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  53.41 
 
 		 550 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  52.34 
 
 		 553 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  52.94 
 
 		 548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1344  dihydroxy-acid dehydratase  51.72 
 
 		 618 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  53.79 
 
 		 552 aa  571  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  52.42 
 
 		 560 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  51.52 
 
 		 553 aa  565  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  51.53 
 
 		 553 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 		 553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  49.42 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1784  dihydroxy-acid dehydratase  50.25 
 
 		 615 aa  555  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5205  dihydroxy-acid dehydratase  49.42 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4149  dihydroxy-acid dehydratase  49.42 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  49.42 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2933  dihydroxy-acid dehydratase  50.58 
 
 		 612 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  50.81 
 
 		 547 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  49.59 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>