More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1769 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  59.1 
 
 
557 aa  681    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  58.2 
 
 
557 aa  678    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  76.26 
 
 
558 aa  881    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  58.92 
 
 
557 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  58.74 
 
 
557 aa  679    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  58.92 
 
 
557 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  59.1 
 
 
557 aa  682    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  56.41 
 
 
561 aa  646    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  58.74 
 
 
557 aa  677    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  71.81 
 
 
559 aa  837    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  74.1 
 
 
558 aa  860    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  76.26 
 
 
558 aa  882    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  58.92 
 
 
557 aa  680    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  58.92 
 
 
557 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  66.85 
 
 
561 aa  766    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  59.1 
 
 
557 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  61.55 
 
 
557 aa  679    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  65.71 
 
 
560 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  78.1 
 
 
557 aa  886    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  64.75 
 
 
561 aa  741    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  57.3 
 
 
557 aa  657    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  59.53 
 
 
554 aa  653    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  65.35 
 
 
560 aa  738    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  65.53 
 
 
560 aa  739    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  57.35 
 
 
565 aa  634    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  57.91 
 
 
558 aa  672    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  79.17 
 
 
582 aa  894    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  58.42 
 
 
558 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  68.57 
 
 
562 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  58.74 
 
 
557 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  81.87 
 
 
557 aa  926    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  58.42 
 
 
613 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
553 aa  1118    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  62.16 
 
 
558 aa  715    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  57.3 
 
 
559 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  76.44 
 
 
558 aa  865    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  57.71 
 
 
562 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  56.63 
 
 
566 aa  634  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  57.53 
 
 
565 aa  633  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  57.35 
 
 
565 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  56.37 
 
 
559 aa  626  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  56.27 
 
 
562 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  54.94 
 
 
569 aa  621  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  56.27 
 
 
562 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  56.09 
 
 
565 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  55.56 
 
 
579 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  53.58 
 
 
580 aa  598  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  54.71 
 
 
577 aa  596  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  52.61 
 
 
552 aa  590  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  54.41 
 
 
554 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  52.97 
 
 
552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  51.72 
 
 
554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  52.71 
 
 
554 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  52.53 
 
 
554 aa  569  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  50.27 
 
 
552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  54.25 
 
 
559 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  52.71 
 
 
556 aa  560  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
555 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 
555 aa  549  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7332  Dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 
612 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 
557 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
555 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  50.36 
 
 
555 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  52.25 
 
 
552 aa  542  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2538  dihydroxy-acid dehydratase  47.52 
 
 
612 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 
553 aa  544  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
560 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  48.36 
 
 
619 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0469  dihydroxy-acid dehydratase  48.59 
 
 
615 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 
556 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0418  dihydroxyacid dehydratase  47.62 
 
 
617 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0213625  decreased coverage  0.00250401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
554 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 
599 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5057  dihydroxy-acid dehydratase  48.26 
 
 
615 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3508  dihydroxy-acid dehydratase  47.27 
 
 
616 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5358  dihydroxy-acid dehydratase  48.42 
 
 
613 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1784  dihydroxy-acid dehydratase  47.36 
 
 
615 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  48.42 
 
 
612 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04630  dihydroxy-acid dehydratase  48.59 
 
 
612 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  48.28 
 
 
552 aa  532  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2723  dihydroxy-acid dehydratase  49.01 
 
 
612 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 
556 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002038  dihydroxy-acid dehydratase  47.92 
 
 
613 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1072  dihydroxy-acid dehydratase  48.52 
 
 
618 aa  534  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
555 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1344  dihydroxy-acid dehydratase  48.12 
 
 
618 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
554 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1648  dihydroxy-acid dehydratase  47.7 
 
 
618 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  47.85 
 
 
616 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4012  dihydroxy-acid dehydratase  47.19 
 
 
616 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4066  dihydroxy-acid dehydratase  47.2 
 
 
619 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405184  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 
550 aa  530  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
557 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4129  dihydroxy-acid dehydratase  47.68 
 
 
616 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1459  dihydroxy-acid dehydratase  48.51 
 
 
612 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 
563 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0988  dihydroxy-acid dehydratase  48.45 
 
 
618 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 
551 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>