More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3211 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3211  Dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 565 aa  1132    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6227  dihydroxy-acid dehydratase  73.1 
 
 		 571 aa  814    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.974759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6396  dihydroxy-acid dehydratase  73.47 
 
 		 571 aa  815    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6629  dihydroxy-acid dehydratase  73.47 
 
 		 571 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5894  dihydroxyacid dehydratase  53.23 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4523  dihydroxy-acid dehydratase  52.49 
 
 		 562 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5111  dihydroxyacid dehydratase  51.08 
 
 		 560 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.679099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3651  dihydroxyacid dehydratase  51.17 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.583324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2585  Dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 		 559 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  38.96 
 
 		 554 aa  364  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  39.22 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  37.97 
 
 		 559 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  37.89 
 
 		 558 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  38.28 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  37.59 
 
 		 552 aa  351  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  36.58 
 
 		 552 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  38.17 
 
 		 554 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  39.07 
 
 		 548 aa  349  7e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  37.12 
 
 		 558 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  36.94 
 
 		 553 aa  346  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  38.62 
 
 		 561 aa  346  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  35.97 
 
 		 554 aa  343  4e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  40.84 
 
 		 569 aa  342  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  36.33 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  35.79 
 
 		 557 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  35.79 
 
 		 557 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  35.79 
 
 		 557 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  35.79 
 
 		 557 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  35.79 
 
 		 557 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  35.79 
 
 		 557 aa  340  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  35.61 
 
 		 557 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  35.79 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  36.02 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  35.79 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  38.26 
 
 		 559 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  35.61 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  35.88 
 
 		 556 aa  336  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  36.69 
 
 		 552 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  37.13 
 
 		 553 aa  335  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  39.11 
 
 		 561 aa  334  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  36.82 
 
 		 554 aa  332  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  37.08 
 
 		 557 aa  331  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  39.82 
 
 		 559 aa  332  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  37.92 
 
 		 565 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  38.59 
 
 		 555 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  36.64 
 
 		 554 aa  329  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  38.35 
 
 		 566 aa  329  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  36.67 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  36.8 
 
 		 563 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  37.7 
 
 		 565 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  39.19 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  36.97 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  39.04 
 
 		 579 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0708  dihydroxy-acid dehydratase  37.18 
 
 		 570 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  37.36 
 
 		 554 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  36.44 
 
 		 565 aa  323  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  36.82 
 
 		 556 aa  323  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  35.77 
 
 		 550 aa  323  7e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  38.26 
 
 		 560 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  35.8 
 
 		 550 aa  323  7e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  38.33 
 
 		 562 aa  320  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  37.54 
 
 		 560 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  37.11 
 
 		 551 aa  319  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  38.08 
 
 		 560 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  38.01 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5915  dihydroxy-acid dehydratase  36.23 
 
 		 569 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1970  Dihydroxy-acid dehydratase  37.94 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  37.21 
 
 		 547 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  36.31 
 
 		 557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  38.83 
 
 		 571 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  37.84 
 
 		 566 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  37.02 
 
 		 547 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  36.67 
 
 		 555 aa  313  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  37.75 
 
 		 563 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1850  Dihydroxy-acid dehydratase  35.71 
 
 		 547 aa  313  6.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0203802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  37.34 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  35.87 
 
 		 555 aa  312  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  37.66 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  35.52 
 
 		 558 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  37.43 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  35.52 
 
 		 558 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  36.43 
 
 		 557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  34.94 
 
 		 558 aa  310  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  36.43 
 
 		 573 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  35.57 
 
 		 547 aa  310  5e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  37.23 
 
 		 561 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  37.87 
 
 		 556 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2863  dihydroxy-acid dehydratase  37.82 
 
 		 557 aa  309  6.999999999999999e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0663507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  35.87 
 
 		 550 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  35.87 
 
 		 555 aa  309  9e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  36.2 
 
 		 576 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  36.2 
 
 		 576 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  36.87 
 
 		 571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  36.43 
 
 		 555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  35.98 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  37.24 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  35.54 
 
 		 579 aa  306  7e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  36.43 
 
 		 553 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  37.73 
 
 		 563 aa  306  8.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  36.94 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>