More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3651 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2585  Dihydroxy-acid dehydratase  66.73 
 
 		 559 aa  748    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3651  dihydroxyacid dehydratase  100 
 
 		 567 aa  1123    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.583324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5894  dihydroxyacid dehydratase  54.73 
 
 		 561 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5111  dihydroxyacid dehydratase  52.17 
 
 		 560 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.679099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4523  dihydroxy-acid dehydratase  53.3 
 
 		 562 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3211  Dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 565 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6396  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 571 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6629  dihydroxy-acid dehydratase  51.17 
 
 		 571 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6227  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.974759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  39.35 
 
 		 552 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  42.62 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  38.7 
 
 		 557 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  38.56 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  38.28 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  41.78 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  37.86 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  38.39 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  38.09 
 
 		 554 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  38.01 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  38.2 
 
 		 555 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  38.66 
 
 		 559 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  37.68 
 
 		 554 aa  361  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  37.36 
 
 		 552 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  37.23 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  37.5 
 
 		 554 aa  360  4e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  37.27 
 
 		 553 aa  360  5e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  38.92 
 
 		 557 aa  359  7e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  37.39 
 
 		 554 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  36.41 
 
 		 554 aa  356  6.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  38.13 
 
 		 557 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  38.99 
 
 		 548 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  38.95 
 
 		 550 aa  350  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  38.88 
 
 		 552 aa  349  9e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  36.84 
 
 		 556 aa  346  8e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  38.95 
 
 		 552 aa  343  7e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  37.83 
 
 		 554 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  35.4 
 
 		 550 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  37.34 
 
 		 555 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  38.87 
 
 		 559 aa  339  9e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  38.5 
 
 		 559 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  38.56 
 
 		 563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  35.25 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  35.44 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  39.74 
 
 		 570 aa  336  5e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  36.67 
 
 		 559 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  35.25 
 
 		 557 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  36.48 
 
 		 557 aa  335  1e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  35.25 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  35.06 
 
 		 557 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  35.06 
 
 		 557 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  35.06 
 
 		 557 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  40.04 
 
 		 567 aa  334  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  34.88 
 
 		 557 aa  334  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  37.59 
 
 		 556 aa  334  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  34.88 
 
 		 557 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  36.33 
 
 		 565 aa  333  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  36.63 
 
 		 551 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  38.35 
 
 		 559 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  34.88 
 
 		 557 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  34.88 
 
 		 557 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  37.41 
 
 		 557 aa  331  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  36.75 
 
 		 565 aa  331  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  37.59 
 
 		 563 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  36.53 
 
 		 566 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  37.36 
 
 		 554 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  35.61 
 
 		 565 aa  329  9e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  33.57 
 
 		 560 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  34.73 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  37.3 
 
 		 570 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1925  dihydroxy-acid dehydratase  38.2 
 
 		 561 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.906776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0740  dihydroxy-acid dehydratase  37.43 
 
 		 562 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  34.2 
 
 		 557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0708  dihydroxy-acid dehydratase  36.58 
 
 		 570 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  36.94 
 
 		 567 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  37.96 
 
 		 553 aa  326  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  36.76 
 
 		 561 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  38.15 
 
 		 575 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  37.08 
 
 		 563 aa  323  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2269  dihydroxy-acid dehydratase  36.46 
 
 		 564 aa  322  8e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.248787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  40.63 
 
 		 556 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  35.88 
 
 		 547 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  37.41 
 
 		 553 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  38.27 
 
 		 558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  37.92 
 
 		 563 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  35.78 
 
 		 557 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  37.5 
 
 		 556 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  35.48 
 
 		 560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  37.48 
 
 		 579 aa  319  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  36.88 
 
 		 571 aa  319  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  35.83 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0900  dihydroxy-acid dehydratase  37.45 
 
 		 564 aa  318  2e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  36.7 
 
 		 556 aa  317  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  36.41 
 
 		 582 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  36.1 
 
 		 573 aa  317  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  37.78 
 
 		 553 aa  316  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  34.96 
 
 		 558 aa  316  6e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  37.39 
 
 		 547 aa  316  9e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  37.71 
 
 		 566 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  36.52 
 
 		 575 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  36.57 
 
 		 550 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0134222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>