More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5111 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5894  dihydroxyacid dehydratase  59.67 
 
 		 561 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5111  dihydroxyacid dehydratase  100 
 
 		 560 aa  1130    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.679099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4523  dihydroxy-acid dehydratase  77.46 
 
 		 562 aa  887    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3651  dihydroxyacid dehydratase  52.17 
 
 		 567 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.583324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2585  Dihydroxy-acid dehydratase  51.44 
 
 		 559 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450911  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6396  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 		 571 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6629  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 		 571 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6227  dihydroxy-acid dehydratase  51.26 
 
 		 571 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.974759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3211  Dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 		 565 aa  545  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  40.74 
 
 		 553 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  41.94 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  38.64 
 
 		 557 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  38.64 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  38.46 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  38.64 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  38.64 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  39.01 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  38.75 
 
 		 557 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  38.46 
 
 		 557 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  38.64 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  38.64 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  39.42 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  38.38 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  38.97 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  38.64 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  39.71 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  39.43 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  38.59 
 
 		 557 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  39.56 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  38.31 
 
 		 554 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  36.82 
 
 		 565 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  39 
 
 		 554 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  39.19 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  38.12 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  38.02 
 
 		 565 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  38.92 
 
 		 565 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  37.57 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  40.56 
 
 		 573 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  38.13 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  37.59 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  37.36 
 
 		 580 aa  365  1e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  37.48 
 
 		 556 aa  363  4e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  38.63 
 
 		 557 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  37.75 
 
 		 555 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  40.04 
 
 		 567 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  39.59 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  36.23 
 
 		 552 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  37.39 
 
 		 557 aa  361  2e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  36.53 
 
 		 554 aa  360  3e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  39.41 
 
 		 571 aa  360  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  37.91 
 
 		 555 aa  360  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  38.28 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  36.81 
 
 		 566 aa  360  5e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  36.97 
 
 		 553 aa  359  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  38.1 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  38.82 
 
 		 552 aa  357  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  37.38 
 
 		 555 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  36.71 
 
 		 559 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  37.45 
 
 		 554 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  37.92 
 
 		 559 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  36.51 
 
 		 572 aa  352  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  37.55 
 
 		 555 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  38.52 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  38.5 
 
 		 575 aa  352  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  38.14 
 
 		 563 aa  352  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  37.25 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  36.09 
 
 		 577 aa  351  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  38.42 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  36.83 
 
 		 557 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  36.46 
 
 		 565 aa  349  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  36.87 
 
 		 573 aa  349  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  38.83 
 
 		 582 aa  349  8e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  38.9 
 
 		 570 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  37.38 
 
 		 565 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  37.99 
 
 		 573 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  39.25 
 
 		 571 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5915  dihydroxy-acid dehydratase  38.78 
 
 		 569 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  38.32 
 
 		 558 aa  347  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  38.6 
 
 		 569 aa  347  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  39.1 
 
 		 567 aa  346  5e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  38.72 
 
 		 579 aa  346  7e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  36.94 
 
 		 589 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  37.45 
 
 		 561 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  39.18 
 
 		 575 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  37.75 
 
 		 551 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  35.42 
 
 		 560 aa  343  5e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  35.48 
 
 		 558 aa  343  5.999999999999999e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  38.13 
 
 		 567 aa  342  9e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  37.27 
 
 		 580 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  37.27 
 
 		 580 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  37.27 
 
 		 580 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  36.68 
 
 		 580 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0746  dihydroxy-acid dehydratase  37.68 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143567  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  37.57 
 
 		 575 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  36.04 
 
 		 558 aa  339  7e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3684  dihydroxy-acid dehydratase  37.14 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0646583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  37.24 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0740  dihydroxy-acid dehydratase  37.43 
 
 		 562 aa  338  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2269  dihydroxy-acid dehydratase  36.27 
 
 		 564 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.248787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  36.86 
 
 		 563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>