More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5894 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5894  dihydroxyacid dehydratase  100 
 
 		 561 aa  1138    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5111  dihydroxyacid dehydratase  59.67 
 
 		 560 aa  660    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.679099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4523  dihydroxy-acid dehydratase  56.91 
 
 		 562 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3651  dihydroxyacid dehydratase  54.73 
 
 		 567 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.583324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6396  dihydroxy-acid dehydratase  54.45 
 
 		 571 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6629  dihydroxy-acid dehydratase  54.45 
 
 		 571 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6227  dihydroxy-acid dehydratase  54.26 
 
 		 571 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.974759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2585  Dihydroxy-acid dehydratase  51.54 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.450911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3211  Dihydroxy-acid dehydratase  53.58 
 
 		 565 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  40.51 
 
 		 548 aa  388  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  40.65 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  39.64 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  40.39 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  39.06 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  38.11 
 
 		 554 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  37.88 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  37.75 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  37.5 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  37.75 
 
 		 554 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  37.88 
 
 		 558 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  39.17 
 
 		 569 aa  363  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  37.75 
 
 		 557 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  38.78 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  38.03 
 
 		 550 aa  361  2e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  36.12 
 
 		 554 aa  359  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  37.25 
 
 		 557 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  37.07 
 
 		 557 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  39.75 
 
 		 567 aa  356  5e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  39.14 
 
 		 547 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  37.9 
 
 		 556 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  39.93 
 
 		 571 aa  355  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  36.89 
 
 		 557 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  37.95 
 
 		 559 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  36.89 
 
 		 557 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  36.71 
 
 		 557 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  36.89 
 
 		 557 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  36.71 
 
 		 557 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  36.71 
 
 		 557 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  36.71 
 
 		 557 aa  353  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  36.89 
 
 		 557 aa  353  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  37.07 
 
 		 557 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  37.66 
 
 		 550 aa  353  7e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  35.75 
 
 		 552 aa  352  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  38.26 
 
 		 555 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  37.64 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  36.71 
 
 		 557 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  37.3 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  38.48 
 
 		 554 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  37.21 
 
 		 552 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  38.46 
 
 		 561 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  37.14 
 
 		 557 aa  350  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  37.57 
 
 		 560 aa  349  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  37.3 
 
 		 550 aa  348  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  37.84 
 
 		 559 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  38.19 
 
 		 547 aa  346  6e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  36.23 
 
 		 558 aa  345  1e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5915  dihydroxy-acid dehydratase  37.89 
 
 		 569 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  37.8 
 
 		 563 aa  345  2e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  38.39 
 
 		 550 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  38.46 
 
 		 570 aa  344  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  37.94 
 
 		 580 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  37.94 
 
 		 580 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  38.21 
 
 		 550 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1850  Dihydroxy-acid dehydratase  36.73 
 
 		 547 aa  343  5.999999999999999e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0203802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  37.94 
 
 		 580 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  37.08 
 
 		 551 aa  343  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  37.61 
 
 		 562 aa  342  8e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  37.77 
 
 		 559 aa  342  9e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  38.87 
 
 		 547 aa  342  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  37.5 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  38.39 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  37.9 
 
 		 558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  38.85 
 
 		 559 aa  340  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  38.15 
 
 		 554 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  35.84 
 
 		 572 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3721  dihydroxy-acid dehydratase  38.29 
 
 		 553 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000618938  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  36.53 
 
 		 555 aa  339  8e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  36.4 
 
 		 557 aa  339  9e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  35.64 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  38.22 
 
 		 556 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  37.41 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  36.06 
 
 		 573 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  37.84 
 
 		 550 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  37.92 
 
 		 567 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  37.54 
 
 		 575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  36.53 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0708  dihydroxy-acid dehydratase  37.41 
 
 		 570 aa  336  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  36.85 
 
 		 565 aa  336  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  37.99 
 
 		 553 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  36.72 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  36.25 
 
 		 580 aa  335  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  37.99 
 
 		 553 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  37.43 
 
 		 553 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  37.02 
 
 		 558 aa  334  3e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  37.21 
 
 		 575 aa  334  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  37.81 
 
 		 563 aa  333  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  37.38 
 
 		 563 aa  333  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  35.67 
 
 		 560 aa  333  7.000000000000001e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  36.74 
 
 		 580 aa  332  8e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  40.99 
 
 		 556 aa  332  8e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>