More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2151 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5915  dihydroxy-acid dehydratase  62.19 
 
 
569 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1920  dihydroxy-acid dehydratase  65.53 
 
 
559 aa  769    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  59.07 
 
 
571 aa  705    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3236  dihydroxy-acid dehydratase  63.13 
 
 
557 aa  724    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000356342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3684  dihydroxy-acid dehydratase  63.08 
 
 
561 aa  740    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0646583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3745  dihydroxy-acid dehydratase  64.75 
 
 
562 aa  767    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20547  homeobox protein  58.56 
 
 
555 aa  670    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34354  predicted protein  58.04 
 
 
567 aa  668    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.311045 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75802  dihydroxyacid dehydratase  58.05 
 
 
604 aa  670    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.747519 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1312  dihydroxy-acid dehydratase  66.07 
 
 
570 aa  754    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.462059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2863  dihydroxy-acid dehydratase  68.47 
 
 
557 aa  801    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0663507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3418  dihydroxy-acid dehydratase  64.75 
 
 
565 aa  745    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2151  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
561 aa  1142    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.950442  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  58.15 
 
 
562 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  57.32 
 
 
558 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06346  hypothetical dihydroxy-acid dehydratase (Eurofung)  56.67 
 
 
613 aa  622  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0344315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2664  dihydroxy-acid dehydratase  58.41 
 
 
570 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01530  dihydroxy-acid dehydratase, putative  54.34 
 
 
596 aa  617  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.454671  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  54.14 
 
 
564 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  52.87 
 
 
560 aa  591  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  53.05 
 
 
563 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  52.87 
 
 
564 aa  584  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  52.5 
 
 
561 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3009  dihydroxy-acid dehydratase  52.51 
 
 
564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0313714  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
557 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 
557 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  52.6 
 
 
564 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  53.51 
 
 
567 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 
557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  52.33 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  52.78 
 
 
557 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  52.23 
 
 
563 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
560 aa  578  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1020  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0472909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1180  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  51.79 
 
 
564 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2379  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  52.71 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  51.88 
 
 
563 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2511  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 
564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.420141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2334  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00290796  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0180  dihydroxy-acid dehydratase  51.36 
 
 
556 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08121  dihydroxy-acid dehydratase  51.36 
 
 
556 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5793  dihydroxy-acid dehydratase  52.16 
 
 
557 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351546 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  52.17 
 
 
557 aa  570  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  51.81 
 
 
556 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 
557 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1851  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 
557 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1027  dihydroxy-acid dehydratase  51.9 
 
 
557 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11595  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2462  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 
557 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2467  dihydroxy-acid dehydratase  51.8 
 
 
557 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43029  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
561 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  51.45 
 
 
556 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 
557 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  52.69 
 
 
562 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  51.99 
 
 
557 aa  568  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3222  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 
568 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.321599 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
557 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2221  dihydroxy-acid dehydratase  52.52 
 
 
557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357683  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
557 aa  564  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  51.99 
 
 
561 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 
557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  50.72 
 
 
557 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  51.25 
 
 
563 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  52.24 
 
 
564 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1921  dihydroxy-acid dehydratase  51.43 
 
 
564 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.472202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  51.62 
 
 
561 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  51.08 
 
 
557 aa  558  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0179  dihydroxy-acid dehydratase  50.63 
 
 
565 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 
559 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3020  dihydroxy-acid dehydratase  52.32 
 
 
574 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
558 aa  548  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04058  hypothetical dihydroxyacid dehydratase (Eurofung)  50.17 
 
 
603 aa  544  1e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0138326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 
561 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
575 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  50.53 
 
 
582 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
570 aa  527  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 
567 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 
572 aa  521  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  50.71 
 
 
563 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
580 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  48.74 
 
 
573 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
567 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
580 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  48.13 
 
 
575 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
580 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  49.11 
 
 
569 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1566  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
567 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 
579 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  46.57 
 
 
559 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  47.46 
 
 
573 aa  514  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>