More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0121 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0121  ribosome recycling factor  100 
 
 
184 aa  366  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.466045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  53.37 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  53.37 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  52.46 
 
 
185 aa  198  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  53.98 
 
 
185 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  53.41 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  53.41 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  53.41 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  53.41 
 
 
185 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  52.84 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  52.84 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  52.84 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  53.71 
 
 
185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  50.57 
 
 
185 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  52 
 
 
185 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  52.27 
 
 
185 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  50 
 
 
185 aa  184  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  47.16 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  49.14 
 
 
186 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  44.07 
 
 
187 aa  181  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  46.02 
 
 
186 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  45.65 
 
 
184 aa  181  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  49.43 
 
 
184 aa  180  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  46.59 
 
 
184 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  50.29 
 
 
185 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.16 
 
 
185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.16 
 
 
185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.43 
 
 
184 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.43 
 
 
184 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.28 
 
 
184 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  48.28 
 
 
174 aa  176  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  47.16 
 
 
186 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  48.85 
 
 
185 aa  174  8e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  46.74 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  46.59 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  43.18 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  44.51 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  44.07 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  48.5 
 
 
185 aa  169  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  44.83 
 
 
185 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  44 
 
 
181 aa  169  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  46.67 
 
 
184 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  44.51 
 
 
185 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  44.57 
 
 
185 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  46.82 
 
 
185 aa  168  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  44.32 
 
 
182 aa  167  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  45.09 
 
 
185 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  47.28 
 
 
183 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  43.93 
 
 
185 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  47.28 
 
 
184 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  44.75 
 
 
185 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  40.76 
 
 
184 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2802  ribosome recycling factor  45.71 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00257577  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  47.46 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  43.5 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  45.45 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  43.75 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  41.85 
 
 
186 aa  162  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1384  ribosome recycling factor  46.55 
 
 
185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000556086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  42.46 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  43.5 
 
 
185 aa  161  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  44.51 
 
 
185 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  46.55 
 
 
185 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  44 
 
 
185 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0116  ribosome recycling factor  44.51 
 
 
187 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  41.62 
 
 
185 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  44.51 
 
 
185 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  44.25 
 
 
185 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  43.93 
 
 
185 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  43.93 
 
 
185 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  43.93 
 
 
185 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  41.14 
 
 
192 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  43.02 
 
 
181 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  41.85 
 
 
185 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  43.18 
 
 
185 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  43.18 
 
 
185 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  43.18 
 
 
185 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  43.18 
 
 
185 aa  158  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  43.68 
 
 
185 aa  157  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  39.2 
 
 
185 aa  157  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  38.46 
 
 
185 aa  157  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  39.2 
 
 
185 aa  157  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  43.18 
 
 
185 aa  157  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0370  ribosome recycling factor  39.46 
 
 
188 aa  157  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210399  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  42.46 
 
 
181 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  43.18 
 
 
185 aa  157  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  41.24 
 
 
187 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  39.78 
 
 
188 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  41.38 
 
 
186 aa  156  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  39.78 
 
 
188 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  45.14 
 
 
185 aa  156  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  42.61 
 
 
185 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  42.2 
 
 
185 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  40.91 
 
 
185 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  41.71 
 
 
182 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  41.71 
 
 
185 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  41.21 
 
 
185 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  41.24 
 
 
187 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0575  ribosome recycling factor  43.18 
 
 
187 aa  155  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  39.55 
 
 
194 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>