More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6302 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  98.26 
 
 
172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.31 
 
 
178 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.71 
 
 
178 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.11 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.11 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  43.45 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  44.24 
 
 
179 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  43.64 
 
 
179 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.11 
 
 
184 aa  140  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  44.63 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.62 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.37 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.37 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.37 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.37 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  41.76 
 
 
233 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.59 
 
 
260 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.67 
 
 
231 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.07 
 
 
231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.67 
 
 
231 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  41.67 
 
 
231 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.69 
 
 
222 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.82 
 
 
234 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.46 
 
 
173 aa  130  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  40.24 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.36 
 
 
195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  40.74 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.98 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  41.98 
 
 
155 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  42.41 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  42.5 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  41.88 
 
 
166 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  43.12 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.09 
 
 
164 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  39.26 
 
 
173 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.38 
 
 
161 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.52 
 
 
155 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  41.25 
 
 
176 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3679  (2Fe-2S)-binding  38.75 
 
 
165 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  37.79 
 
 
158 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.38 
 
 
163 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.88 
 
 
159 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  38.75 
 
 
164 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0595  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.62 
 
 
168 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.38 
 
 
158 aa  104  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40 
 
 
152 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.98 
 
 
157 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  40.12 
 
 
152 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  39.63 
 
 
163 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  38.18 
 
 
480 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.76 
 
 
160 aa  102  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  39.38 
 
 
158 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.75 
 
 
158 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4735  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.88 
 
 
157 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854984  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  37.35 
 
 
163 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4202  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.42 
 
 
240 aa  101  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1453  (2Fe-2S)-binding  37.21 
 
 
161 aa  101  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.422903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.99 
 
 
155 aa  101  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  38.75 
 
 
152 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  38.46 
 
 
156 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.98 
 
 
157 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.37 
 
 
157 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.62 
 
 
163 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  39.41 
 
 
218 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  36.59 
 
 
163 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4549  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.36 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730193  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.88 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.75 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.33 
 
 
154 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.85 
 
 
154 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0737  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  40.76 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  41.4 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  38.04 
 
 
165 aa  99  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  39.26 
 
 
154 aa  99  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  36.59 
 
 
162 aa  99  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.5 
 
 
164 aa  99  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3810  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.37 
 
 
257 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1055  putative iron-sulfur binding protein  37.74 
 
 
173 aa  98.2  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847853  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.99 
 
 
170 aa  98.2  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4377  (2Fe-2S)-binding domain protein  40.38 
 
 
167 aa  98.2  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  38.56 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  37.65 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0479  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.27 
 
 
191 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.97 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2320  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.5 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0916  twin-arginine translocation pathway signal  36.25 
 
 
233 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  35.22 
 
 
499 aa  97.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.22 
 
 
157 aa  97.4  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1763  (2Fe-2S)-binding  38.36 
 
 
161 aa  97.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  41.88 
 
 
157 aa  97.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0278  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  42.86 
 
 
181 aa  97.4  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5103  oxidoreductase with iron-sulfur subunit  36.63 
 
 
212 aa  97.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  37.5 
 
 
152 aa  97.4  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2878  putative carbon-monoxide dehydrogenase small chain  36.65 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.34 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0913  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  35.15 
 
 
161 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0511  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.47 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4234  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.5 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>