More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3947 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  99.13 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  96.28 
 
 
233 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  95.21 
 
 
231 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  93.09 
 
 
222 aa  380  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  94.15 
 
 
234 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  82.54 
 
 
260 aa  339  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  74.57 
 
 
184 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.6 
 
 
184 aa  298  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  63.48 
 
 
179 aa  264  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  64.61 
 
 
179 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  64.61 
 
 
179 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.1 
 
 
195 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.28 
 
 
181 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.54 
 
 
177 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.27 
 
 
178 aa  248  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.54 
 
 
177 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.92 
 
 
178 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.92 
 
 
178 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.54 
 
 
177 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.54 
 
 
177 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  62.64 
 
 
178 aa  248  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.36 
 
 
178 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.8 
 
 
178 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.99 
 
 
173 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.42 
 
 
172 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.67 
 
 
172 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  38.01 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  33.33 
 
 
250 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  37.5 
 
 
176 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  37.28 
 
 
155 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  36.7 
 
 
251 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.15 
 
 
241 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1675  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.98 
 
 
162 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.416655  normal  0.458733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.7 
 
 
251 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2189  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.33 
 
 
215 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0339293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0111  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.35 
 
 
214 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.53 
 
 
161 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1570  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.99 
 
 
157 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0820711  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.16 
 
 
164 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.42 
 
 
157 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.12 
 
 
180 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  38.65 
 
 
173 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  38.41 
 
 
153 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.53 
 
 
405 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  35.26 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.26 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.73 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  35.54 
 
 
158 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.12 
 
 
252 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  35.98 
 
 
170 aa  99.4  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.44 
 
 
246 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3112  (2Fe-2S)-binding protein  37.42 
 
 
162 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153526  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  37.65 
 
 
161 aa  98.6  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.36 
 
 
155 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00927  putative oxidoreductase, iron-sulphur binding subunit  33.53 
 
 
165 aa  98.6  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  33.82 
 
 
199 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.94 
 
 
173 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.61 
 
 
219 aa  98.2  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0128  ferredoxin  31.37 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.512619  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.81 
 
 
154 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.51 
 
 
160 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  33.97 
 
 
161 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1631  (2Fe-2S)-binding  36.02 
 
 
161 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2775  hypothetical protein  38.36 
 
 
157 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119286  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.13 
 
 
163 aa  95.9  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2166  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.17 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2054  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.21 
 
 
191 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.682344 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5356  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  30.39 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.130334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  32.8 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.55 
 
 
174 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.57 
 
 
154 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652402  normal  0.0357628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0737  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  36.77 
 
 
163 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2813  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.2 
 
 
165 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.884029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6668  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  35.4 
 
 
159 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.241103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.2 
 
 
165 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  32.32 
 
 
165 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4729  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.82 
 
 
259 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117621 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.58 
 
 
399 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2562  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.25 
 
 
168 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.13 
 
 
467 aa  95.1  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1570  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.73 
 
 
157 aa  95.1  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.939905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  38 
 
 
173 aa  95.1  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0425  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  35.37 
 
 
169 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.56858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  34.78 
 
 
161 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2931  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.27 
 
 
164 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0748956  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0058  (2Fe-2S)-binding  36.65 
 
 
161 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.325348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.42 
 
 
158 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5461  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  32.02 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.11 
 
 
155 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  33.33 
 
 
162 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4272  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.81 
 
 
167 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  30.52 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5888  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  34.3 
 
 
190 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00574873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3678  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  35.4 
 
 
165 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.42 
 
 
163 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4528  (2Fe-2S)-binding  33.54 
 
 
161 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0100  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.15 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.88 
 
 
157 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>