More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1105 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1105  (2Fe-2S)-binding  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0859  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  88.76 
 
 
178 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0967  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  87.57 
 
 
177 aa  331  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0987  (2Fe-2S)-binding domain protein  87.57 
 
 
177 aa  331  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1002  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  87.57 
 
 
177 aa  331  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3375  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  87.57 
 
 
177 aa  331  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4017  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.22 
 
 
184 aa  254  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.14297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5886  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.79 
 
 
231 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.358775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1542  (2Fe-2S)-binding protein  63.22 
 
 
233 aa  245  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41803  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4313  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.37 
 
 
234 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598008  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.22 
 
 
222 aa  244  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.364223  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3852  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.79 
 
 
231 aa  243  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.572139  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4419  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.64 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3947  (2Fe-2S)-binding  62.64 
 
 
231 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1416  (2Fe-2S)-binding  58.05 
 
 
184 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0126673  normal  0.0447447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4953  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.92 
 
 
260 aa  238  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124966  normal  0.0248839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5265  hypothetical protein  57.14 
 
 
179 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1906  ferredoxin  56.55 
 
 
179 aa  228  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61140  hypothetical protein  55.95 
 
 
179 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00162409  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3170  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.93 
 
 
195 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231144  hitchhiker  0.000119558 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3557  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.36 
 
 
178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4233  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.36 
 
 
178 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1631  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.36 
 
 
178 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3799  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.76 
 
 
178 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6203  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.6 
 
 
181 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243551  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1275  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.42 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.63 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0816283  normal  0.470974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6302  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.63 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.22325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4413  (2Fe-2S)-binding protein  41.42 
 
 
155 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332473  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4114  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.79 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205007  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0298  glyceraldehyde oxidoreductase small chain  36.21 
 
 
162 aa  104  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2371  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.53 
 
 
180 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36 
 
 
158 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1015  (2Fe-2S)-binding  40.54 
 
 
163 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  37.95 
 
 
163 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1958  (2Fe-2S)-binding  39.64 
 
 
153 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.210445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3095  (2Fe-2S)-binding protein  38.98 
 
 
164 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0223  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.27 
 
 
158 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  36 
 
 
158 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2229  (2Fe-2S)-binding domain-containing protein  39.29 
 
 
170 aa  101  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.144111 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.43 
 
 
185 aa  101  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  35.26 
 
 
163 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1024  (2Fe-2S)-binding  34.91 
 
 
165 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89544  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2864  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.75 
 
 
251 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  37.82 
 
 
161 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1999  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  40.74 
 
 
853 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2224  2Fe-2S ferredoxin  33.52 
 
 
250 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7157  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  38.89 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2341  (2Fe-2S)-binding  36.75 
 
 
252 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2183  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.99 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0170  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.31 
 
 
173 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2955  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.75 
 
 
252 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0333193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0872  putative oxidoreductase with iron-sulfur subunit  34.09 
 
 
164 aa  99  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.283899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1513  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.97 
 
 
163 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0499  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.28 
 
 
155 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577821  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0574  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  34.88 
 
 
161 aa  99  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3001  ferredoxin  36.75 
 
 
251 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2388  twin-arginine translocation pathway signal  35.26 
 
 
226 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2248  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.65 
 
 
158 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.959119  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0582  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 
199 aa  98.6  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0224  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, gamma subunit  36.36 
 
 
161 aa  98.2  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2976  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.75 
 
 
252 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3029  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.97 
 
 
246 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.21 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0365  (2Fe-2S)-binding  39.76 
 
 
173 aa  98.2  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  35.54 
 
 
163 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  32.18 
 
 
158 aa  97.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3810  (2Fe-2S)-binding domain protein  32.07 
 
 
257 aa  97.4  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2075  oxidoreductase, iron-sulfur subunit  36.99 
 
 
176 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8052  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3209  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.41 
 
 
138 aa  97.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0449  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.46 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.583963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.51 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.27 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0913  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  34.12 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6668  putative carbon monoxide dehydrogenase, small chain CutC  38.79 
 
 
159 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  0.241103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5989  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.66 
 
 
241 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6206  putative xanthine dehydrogenase YagT-like, iron-sulfur binding subunit  34.94 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2774  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4986  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.29 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.898404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2654  4Fe-4S binding domain protein  36.2 
 
 
225 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0493248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.58 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.63 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6671  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  35.09 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118313  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4528  (2Fe-2S)-binding  32.94 
 
 
161 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.261283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4691  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.29 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4603  (2Fe-2S)-binding protein  38.29 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  36.42 
 
 
153 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2922  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.14 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  37.06 
 
 
152 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5186  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.67 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.075837 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.06 
 
 
152 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1525  (2Fe-2S)-binding  38.51 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.385333  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  34.66 
 
 
164 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3871  (2Fe-2S)-binding domain protein  36.14 
 
 
154 aa  95.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  35.37 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.52 
 
 
219 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0220  putative dehydrogenase  36.42 
 
 
951 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.733217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2949  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  36.14 
 
 
249 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.581185  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1039  (2Fe-2S)-binding  36.42 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4484  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  37.58 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  35.37 
 
 
152 aa  94.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>