More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3128 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
158 aa  326  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  62.82 
 
 
158 aa  214  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.65 
 
 
158 aa  163  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.74 
 
 
151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1037  (2Fe-2S)-binding  53.33 
 
 
179 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.365772  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
151 aa  160  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2234  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.39 
 
 
185 aa  160  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000284749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54 
 
 
158 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000354076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  48 
 
 
187 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  46.45 
 
 
163 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  48.3 
 
 
166 aa  157  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.65 
 
 
162 aa  157  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.32 
 
 
153 aa  154  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  52.26 
 
 
155 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  47.68 
 
 
154 aa  154  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3596  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  48.37 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0591004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  46.67 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3868  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.33 
 
 
181 aa  154  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505784  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  45.81 
 
 
163 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  51.77 
 
 
153 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0528  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.08 
 
 
171 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.02 
 
 
155 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.71 
 
 
170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2184  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.37 
 
 
160 aa  151  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.30857  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.52 
 
 
157 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  47.37 
 
 
152 aa  151  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  50.99 
 
 
155 aa  150  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  49.03 
 
 
165 aa  150  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
152 aa  150  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.52 
 
 
157 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  48.98 
 
 
162 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  47.33 
 
 
162 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0237  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.37 
 
 
168 aa  149  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.7 
 
 
148 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  41.86 
 
 
176 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.7 
 
 
157 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.45 
 
 
171 aa  147  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.41 
 
 
161 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.87 
 
 
157 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1873  (2Fe-2S)-binding protein  50.34 
 
 
191 aa  147  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  52.99 
 
 
176 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  52.55 
 
 
161 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.99 
 
 
159 aa  147  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  47.97 
 
 
149 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0610  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.37 
 
 
170 aa  147  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.579224  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.42 
 
 
157 aa  146  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.71 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.33 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0095  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.51 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739421  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  51.72 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0843  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.39 
 
 
160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152719 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0416  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.41 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  44.9 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.81 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  44.81 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.94 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  47.02 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.33 
 
 
155 aa  144  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0972  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.02 
 
 
160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0216815  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.42 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1361  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.52 
 
 
174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4351  putative carbon-monoxide dehydrogenase, small subunit (CoxS)  42.58 
 
 
176 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.89 
 
 
180 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0340  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.74 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3213  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.28 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  45.7 
 
 
166 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  47.97 
 
 
153 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.1 
 
 
168 aa  144  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0370  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.58 
 
 
172 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.87 
 
 
157 aa  143  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.05 
 
 
163 aa  143  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3281  (2Fe-2S)-binding protein  48 
 
 
169 aa  143  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0825523  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.34 
 
 
188 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0177  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46 
 
 
152 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0550651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5318  putative carbon-monoxide dehydrogenase small subunit, coxS-like protein  48.03 
 
 
161 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.86 
 
 
178 aa  142  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.22 
 
 
166 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  44.22 
 
 
166 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.22 
 
 
166 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2765  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.51 
 
 
165 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00163035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3298  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.82 
 
 
155 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  47.52 
 
 
153 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.21 
 
 
155 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.68 
 
 
157 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.15 
 
 
156 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.01 
 
 
155 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.85 
 
 
163 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2520  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.58 
 
 
228 aa  141  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.746665  normal  0.752418 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1159  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.14 
 
 
149 aa  141  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1631  (2Fe-2S)-binding  47.37 
 
 
161 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.32 
 
 
172 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.92 
 
 
164 aa  141  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2878  putative carbon-monoxide dehydrogenase small chain  45.33 
 
 
160 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.685063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1948  (2Fe-2S)-binding  45.7 
 
 
165 aa  141  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.03276  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.37 
 
 
155 aa  140  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0223  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.74 
 
 
158 aa  141  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3977  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.98 
 
 
153 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156195  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1354  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.86 
 
 
175 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0194  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.44 
 
 
154 aa  141  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5972  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  46.94 
 
 
150 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>