More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2854 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  100 
 
 
155 aa  320  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  66.45 
 
 
166 aa  223  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.24 
 
 
187 aa  220  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.05 
 
 
157 aa  209  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.82 
 
 
158 aa  206  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  65.77 
 
 
151 aa  205  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2266  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.35 
 
 
168 aa  205  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0955728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.67 
 
 
159 aa  203  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.58 
 
 
161 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.58 
 
 
161 aa  202  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.76 
 
 
153 aa  201  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.9 
 
 
188 aa  201  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.13 
 
 
155 aa  201  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1414  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.75 
 
 
150 aa  201  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0660371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.95 
 
 
151 aa  199  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.59 
 
 
153 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2823  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.95 
 
 
172 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0515601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1629  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.95 
 
 
172 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2747  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.95 
 
 
172 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3049  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  63.09 
 
 
164 aa  197  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  66.89 
 
 
157 aa  197  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.84 
 
 
159 aa  197  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2730  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.27 
 
 
172 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2425  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.27 
 
 
167 aa  197  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2950  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.9 
 
 
157 aa  196  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  61.22 
 
 
153 aa  196  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.51 
 
 
151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1496  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  60.14 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1504  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.64 
 
 
163 aa  194  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62 
 
 
153 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  62 
 
 
153 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  62 
 
 
153 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.54 
 
 
153 aa  194  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1439  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
165 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.54 
 
 
153 aa  194  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.33 
 
 
153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.79 
 
 
167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.54 
 
 
152 aa  194  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  62.16 
 
 
151 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2224  (2Fe-2S)-binding  62.76 
 
 
150 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  59.86 
 
 
153 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.86 
 
 
153 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  61.07 
 
 
153 aa  193  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0278  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  64.79 
 
 
181 aa  193  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  57.62 
 
 
151 aa  193  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  58.82 
 
 
155 aa  193  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.78 
 
 
151 aa  193  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.78 
 
 
151 aa  193  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  58.78 
 
 
151 aa  193  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.71 
 
 
155 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.26 
 
 
155 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.26 
 
 
155 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  55.48 
 
 
170 aa  192  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  65.36 
 
 
155 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  60.26 
 
 
155 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.18 
 
 
153 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.33 
 
 
153 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.33 
 
 
153 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2320  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
152 aa  192  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.11 
 
 
151 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.11 
 
 
151 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.33 
 
 
153 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  58.11 
 
 
151 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  61.69 
 
 
154 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.14 
 
 
151 aa  190  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  55.63 
 
 
152 aa  190  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2620  (2Fe-2S)-binding  58.78 
 
 
153 aa  190  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  61.9 
 
 
163 aa  190  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  61.64 
 
 
153 aa  190  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
153 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  59.73 
 
 
153 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.94 
 
 
146 aa  189  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
153 aa  189  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  54.19 
 
 
156 aa  189  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  60.54 
 
 
153 aa  189  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3438  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  61.38 
 
 
151 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.14 
 
 
153 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211012  normal  0.305671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.18 
 
 
162 aa  189  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.14 
 
 
153 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
153 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  58.11 
 
 
152 aa  188  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  55.92 
 
 
153 aa  188  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.11 
 
 
154 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  55.92 
 
 
152 aa  188  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.25 
 
 
163 aa  188  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  55.92 
 
 
152 aa  188  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  53.55 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  58.78 
 
 
152 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.59 
 
 
171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.78 
 
 
151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  58.11 
 
 
149 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.33 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  59.73 
 
 
154 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1416  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.63 
 
 
154 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.76 
 
 
151 aa  186  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  55.26 
 
 
152 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>