More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2516 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  100 
 
 
176 aa  357  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.62 
 
 
167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  71.43 
 
 
163 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  67.74 
 
 
163 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  70 
 
 
160 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  67.88 
 
 
172 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  67.74 
 
 
172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.18 
 
 
180 aa  209  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.67 
 
 
167 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.79 
 
 
157 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  66.04 
 
 
167 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.04 
 
 
167 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  65.79 
 
 
157 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.13 
 
 
157 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  64.74 
 
 
165 aa  204  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.2 
 
 
185 aa  203  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.54 
 
 
157 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.99 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.79 
 
 
157 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.9 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.24 
 
 
174 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.67 
 
 
155 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.99 
 
 
167 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  55.97 
 
 
164 aa  183  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  59.86 
 
 
150 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.5 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.73 
 
 
156 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.39 
 
 
166 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.39 
 
 
166 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  58.39 
 
 
166 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.69 
 
 
166 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  63.51 
 
 
196 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.41 
 
 
156 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.69 
 
 
166 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.07 
 
 
156 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55 
 
 
164 aa  174  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  54.97 
 
 
166 aa  173  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.7 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.72 
 
 
195 aa  168  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  55.1 
 
 
157 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  50 
 
 
155 aa  164  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  53.74 
 
 
154 aa  163  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  54.42 
 
 
155 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  55.71 
 
 
153 aa  160  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.3 
 
 
158 aa  158  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.42 
 
 
163 aa  158  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  48.68 
 
 
155 aa  157  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.34 
 
 
162 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4125  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.24 
 
 
154 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.02 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3298  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.15 
 
 
155 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  48.3 
 
 
168 aa  154  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3213  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.88 
 
 
155 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  52.94 
 
 
155 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1159  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.59 
 
 
149 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.02 
 
 
151 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  53.74 
 
 
152 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.59 
 
 
177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.32 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  47.37 
 
 
170 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.03 
 
 
163 aa  150  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.79 
 
 
157 aa  150  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  51.7 
 
 
154 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.07 
 
 
171 aa  150  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  48.98 
 
 
151 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  41.21 
 
 
176 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  48.98 
 
 
151 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
151 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
151 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
151 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.94 
 
 
187 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.66 
 
 
151 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.95 
 
 
151 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.35 
 
 
158 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  48.98 
 
 
151 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.33 
 
 
155 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
151 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
151 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.7 
 
 
153 aa  148  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
151 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.35 
 
 
146 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2473  ferredoxin  50.34 
 
 
151 aa  147  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411449  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.31 
 
 
157 aa  147  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  47.26 
 
 
151 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  51.7 
 
 
152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.95 
 
 
151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25850  Ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  50.64 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2287  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  46.94 
 
 
148 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.418047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
154 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.01 
 
 
155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  48.28 
 
 
149 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  45.91 
 
 
156 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.01 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  48.3 
 
 
152 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3941  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.02 
 
 
181 aa  144  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.54 
 
 
158 aa  144  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.98 
 
 
159 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  49.67 
 
 
153 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2296  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.98 
 
 
151 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  45.39 
 
 
156 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>