More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3582 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  95.51 
 
 
157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  94.87 
 
 
157 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  90.73 
 
 
155 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  68.59 
 
 
163 aa  234  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  71.05 
 
 
163 aa  233  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.92 
 
 
180 aa  226  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  69.28 
 
 
167 aa  221  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  72.3 
 
 
160 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  73.29 
 
 
172 aa  217  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  70.95 
 
 
172 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  67.76 
 
 
167 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.76 
 
 
167 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.76 
 
 
167 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.11 
 
 
185 aa  214  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  67.79 
 
 
165 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.22 
 
 
180 aa  208  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.46 
 
 
157 aa  208  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  65.13 
 
 
176 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  65.79 
 
 
157 aa  203  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.86 
 
 
167 aa  196  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.04 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
178 aa  191  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  60.81 
 
 
150 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.16 
 
 
174 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  57.52 
 
 
164 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.06 
 
 
156 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.42 
 
 
156 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  65.33 
 
 
196 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.65 
 
 
195 aa  177  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.77 
 
 
156 aa  175  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.1 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  55.1 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.1 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.73 
 
 
164 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.78 
 
 
166 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.05 
 
 
170 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.78 
 
 
166 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  54.42 
 
 
166 aa  168  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  52.26 
 
 
157 aa  168  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  52.35 
 
 
151 aa  167  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.78 
 
 
163 aa  166  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  47.06 
 
 
166 aa  163  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  52.29 
 
 
155 aa  160  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  52.32 
 
 
155 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  46.98 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.35 
 
 
188 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  50.33 
 
 
152 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  54.42 
 
 
152 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.98 
 
 
158 aa  158  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.35 
 
 
151 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  51.7 
 
 
154 aa  158  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  51.35 
 
 
151 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  47.71 
 
 
166 aa  158  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.35 
 
 
151 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  51.35 
 
 
151 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.38 
 
 
146 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.35 
 
 
171 aa  156  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  50.68 
 
 
151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.68 
 
 
151 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.35 
 
 
153 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.65 
 
 
151 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0177  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.97 
 
 
152 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0550651  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  48.98 
 
 
155 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.98 
 
 
187 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  49.66 
 
 
152 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.66 
 
 
155 aa  154  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  47.97 
 
 
450 aa  153  8e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  49.35 
 
 
154 aa  153  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.55 
 
 
154 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.06 
 
 
154 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  48.63 
 
 
149 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  43.1 
 
 
176 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.7 
 
 
146 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0838259  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.08 
 
 
146 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  49.67 
 
 
163 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2111  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.74 
 
 
146 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.34 
 
 
157 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  50.68 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  46.36 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  49.66 
 
 
151 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  49.65 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.37 
 
 
153 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
159 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.32 
 
 
151 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.98 
 
 
151 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.01 
 
 
161 aa  150  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.81 
 
 
161 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.32 
 
 
151 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.01 
 
 
161 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.3 
 
 
163 aa  150  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  47.65 
 
 
153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.03 
 
 
157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  49.01 
 
 
162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.65 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.01 
 
 
155 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  50.68 
 
 
152 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6324  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.02 
 
 
156 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633542  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.01 
 
 
155 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>