More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2492 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  100 
 
 
157 aa  320  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  63.64 
 
 
163 aa  213  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  62.99 
 
 
163 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.35 
 
 
155 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.67 
 
 
157 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  66.67 
 
 
157 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.46 
 
 
157 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.79 
 
 
195 aa  200  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.34 
 
 
185 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  64.83 
 
 
180 aa  196  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  64.79 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  66.91 
 
 
165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  59.24 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.62 
 
 
167 aa  193  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.62 
 
 
167 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.22 
 
 
167 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.35 
 
 
172 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  56.95 
 
 
167 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.95 
 
 
167 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.57 
 
 
180 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  63.09 
 
 
160 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.46 
 
 
157 aa  186  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.96 
 
 
174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.11 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.1 
 
 
155 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.24 
 
 
156 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.24 
 
 
156 aa  176  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  62.76 
 
 
196 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.19 
 
 
178 aa  174  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.29 
 
 
170 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  53.74 
 
 
150 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.96 
 
 
164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  51.63 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.15 
 
 
166 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.15 
 
 
166 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  53.15 
 
 
166 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  53.85 
 
 
157 aa  160  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.15 
 
 
166 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.15 
 
 
166 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  55.38 
 
 
166 aa  155  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.74 
 
 
163 aa  155  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  49.67 
 
 
152 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1159  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
149 aa  153  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.26 
 
 
151 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  49.32 
 
 
149 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.65 
 
 
162 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.7 
 
 
168 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.06 
 
 
155 aa  147  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.95 
 
 
163 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  47.4 
 
 
155 aa  146  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.64 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  45 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  49.34 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  42.2 
 
 
176 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.64 
 
 
154 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  44.74 
 
 
166 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.43 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.65 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4125  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
154 aa  143  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  47.02 
 
 
152 aa  143  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  51.45 
 
 
155 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0874  (2Fe-2S)-binding  48.67 
 
 
149 aa  143  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.267928  normal  0.0847123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0864  (2Fe-2S)-binding  47.59 
 
 
158 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  48.59 
 
 
153 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.71 
 
 
155 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  44.81 
 
 
154 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4457  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.77 
 
 
150 aa  141  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  45.58 
 
 
155 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  44.85 
 
 
168 aa  141  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  44.9 
 
 
154 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.55 
 
 
153 aa  140  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1692  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.23 
 
 
146 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.814616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3128  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.82 
 
 
158 aa  140  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0546642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  45.89 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2091  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.55 
 
 
155 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.512796 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0177  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.08 
 
 
152 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0550651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.03 
 
 
161 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.26 
 
 
159 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  46.05 
 
 
152 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3298  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.61 
 
 
155 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114503  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1346  (2Fe-2S)-binding protein  41.86 
 
 
175 aa  137  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  44.52 
 
 
163 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.59 
 
 
163 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.58 
 
 
161 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.7 
 
 
148 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.58 
 
 
161 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.86 
 
 
154 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1768  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.83 
 
 
155 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  44.14 
 
 
152 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  47.18 
 
 
156 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  45.83 
 
 
154 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2568  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.04 
 
 
160 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133715  hitchhiker  0.000000432495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3213  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.81 
 
 
155 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2473  ferredoxin  44.3 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411449  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3627  putative isoquinoline 1-oxidoreductase (alpha subunit) oxidoreductase protein  50 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.775317  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  44.37 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.77 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  42.18 
 
 
166 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  44 
 
 
154 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  41.06 
 
 
152 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>