More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4331 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
172 aa  346  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  94.19 
 
 
172 aa  326  9e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  74.66 
 
 
157 aa  222  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  74.66 
 
 
157 aa  220  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  69.33 
 
 
163 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  69.33 
 
 
163 aa  217  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  73.29 
 
 
157 aa  217  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.5 
 
 
167 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  67.88 
 
 
176 aa  215  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  74.15 
 
 
155 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.11 
 
 
180 aa  214  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  67.1 
 
 
165 aa  204  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  66.67 
 
 
160 aa  204  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  68.24 
 
 
157 aa  203  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.35 
 
 
167 aa  201  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.35 
 
 
167 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  63.35 
 
 
167 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.5 
 
 
185 aa  196  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  66.21 
 
 
180 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.35 
 
 
157 aa  191  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  65.1 
 
 
167 aa  187  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.06 
 
 
178 aa  187  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.49 
 
 
174 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  62.42 
 
 
196 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  60.13 
 
 
164 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.33 
 
 
156 aa  185  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.73 
 
 
155 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.53 
 
 
156 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  58.5 
 
 
150 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.55 
 
 
156 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  51.52 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.52 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.52 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  54.36 
 
 
157 aa  170  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.91 
 
 
166 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50.91 
 
 
166 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  50.65 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.46 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.36 
 
 
164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.31 
 
 
195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.34 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.7 
 
 
162 aa  158  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  51.7 
 
 
154 aa  156  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.02 
 
 
155 aa  155  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  42.44 
 
 
176 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  46.05 
 
 
168 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  49.68 
 
 
154 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.34 
 
 
187 aa  153  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.78 
 
 
171 aa  153  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  47.62 
 
 
155 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  46.98 
 
 
153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  50.67 
 
 
151 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.68 
 
 
158 aa  149  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.33 
 
 
151 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  46.9 
 
 
149 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1346  (2Fe-2S)-binding protein  45.66 
 
 
175 aa  147  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  50.94 
 
 
155 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  47.97 
 
 
151 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.67 
 
 
188 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.63 
 
 
151 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.97 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.97 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  49.01 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  48.63 
 
 
151 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.63 
 
 
151 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  47.97 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  48.34 
 
 
152 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.41 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.54 
 
 
168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  50 
 
 
153 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.26 
 
 
152 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0766  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.75 
 
 
154 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  48 
 
 
163 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2836  (2Fe-2S)-binding domain protein  47.97 
 
 
171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  46.58 
 
 
151 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2296  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  45.27 
 
 
153 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.89 
 
 
151 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  46 
 
 
153 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.63 
 
 
153 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  53.96 
 
 
161 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.63 
 
 
153 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2833  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.32 
 
 
151 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120723  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.21 
 
 
177 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  48.63 
 
 
153 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  46.58 
 
 
166 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.03 
 
 
158 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2112  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
151 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  43.71 
 
 
153 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3621  (2Fe-2S)-binding domain protein  49.32 
 
 
151 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588972  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0014  (2Fe-2S)-binding domain protein  50.36 
 
 
151 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.652545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.32 
 
 
161 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1703  (2Fe-2S)-binding protein  48.32 
 
 
167 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
161 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.98 
 
 
163 aa  141  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2696  (2Fe-2S)-binding domain protein  45.68 
 
 
164 aa  141  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0280354  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.95 
 
 
153 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.94 
 
 
157 aa  141  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.95 
 
 
153 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>