More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0273 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0273  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
157 aa  321  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  66.67 
 
 
158 aa  223  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3933  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.42 
 
 
159 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0782071  normal  0.326869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.16 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  66.89 
 
 
155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6606  (2Fe-2S)-binding domain protein  64.33 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0063446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.7 
 
 
153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  64.67 
 
 
151 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.35 
 
 
171 aa  208  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4470  ferredoxin/oxidoreductase  63.01 
 
 
153 aa  207  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325176  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  62.34 
 
 
154 aa  207  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  63.01 
 
 
153 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.01 
 
 
153 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.42 
 
 
157 aa  207  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.33 
 
 
153 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1231  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.01 
 
 
153 aa  206  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1256  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.01 
 
 
153 aa  206  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6069  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.15 
 
 
159 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  61.04 
 
 
156 aa  203  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.7 
 
 
151 aa  203  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4529  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.26 
 
 
161 aa  202  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0685018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4989  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.26 
 
 
161 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.824412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  57.42 
 
 
166 aa  202  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5042  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.24 
 
 
159 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179496  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.39 
 
 
177 aa  201  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0049  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.11 
 
 
188 aa  199  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0706173  normal  0.653074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3049  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  64.38 
 
 
164 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.7 
 
 
153 aa  199  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3426  ferredoxin  62.09 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  59.18 
 
 
168 aa  199  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.42 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
151 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  63.51 
 
 
153 aa  198  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  62.16 
 
 
151 aa  197  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2266  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.59 
 
 
168 aa  197  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0955728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  62.16 
 
 
151 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
151 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  62.16 
 
 
151 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
163 aa  197  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3490  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  60.27 
 
 
153 aa  197  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1439  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.45 
 
 
165 aa  197  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
155 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
155 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  60 
 
 
155 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1496  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.45 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1504  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.45 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2950  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.96 
 
 
157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2620  (2Fe-2S)-binding  61.49 
 
 
153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2730  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.5 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  60.14 
 
 
152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3438  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  62.84 
 
 
151 aa  194  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0641  Iron sulfer protein  65.1 
 
 
164 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.14 
 
 
163 aa  194  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4547  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.33 
 
 
152 aa  195  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.81 
 
 
154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1629  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.81 
 
 
172 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403047 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2823  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.81 
 
 
172 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0515601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2747  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.81 
 
 
172 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
151 aa  194  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  64.29 
 
 
153 aa  193  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4893  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.27 
 
 
148 aa  193  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2425  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.11 
 
 
167 aa  192  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.54 
 
 
163 aa  192  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.11 
 
 
153 aa  191  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.49 
 
 
151 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  60.54 
 
 
162 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3557  (2Fe-2S)-binding  60.14 
 
 
152 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.608806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.69 
 
 
159 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  62.76 
 
 
153 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  60.14 
 
 
152 aa  191  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
152 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.81 
 
 
151 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02524  putative aldehyde dehydrogenase subunit III  57.82 
 
 
166 aa  191  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
162 aa  191  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3868  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.27 
 
 
181 aa  191  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505784  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1831  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.18 
 
 
155 aa  191  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.672438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3679  (2Fe-2S)-binding  57.82 
 
 
165 aa  191  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.84 
 
 
151 aa  190  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3614  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.84 
 
 
164 aa  190  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2224  (2Fe-2S)-binding  61.11 
 
 
150 aa  190  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.49 
 
 
167 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2320  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.46 
 
 
152 aa  189  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3606  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.43 
 
 
154 aa  189  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.20509  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3087  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.18 
 
 
157 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.544744  normal  0.0177824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1414  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.31 
 
 
150 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0660371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1416  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.6 
 
 
154 aa  189  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  56.86 
 
 
156 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0177  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.22 
 
 
152 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0550651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2461  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.69 
 
 
159 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  59.74 
 
 
163 aa  188  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  62.16 
 
 
151 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3776  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.86 
 
 
152 aa  188  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.69 
 
 
164 aa  188  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.85 
 
 
151 aa  188  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  59.18 
 
 
162 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0068  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.16 
 
 
167 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  56.86 
 
 
156 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1703  (2Fe-2S)-binding protein  58.06 
 
 
167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>