More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2424 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2424  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  100 
 
 
160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1890  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.97 
 
 
157 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3947  (2Fe-2S)-binding domain protein  72.97 
 
 
157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0468181  normal  0.360415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3582  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  72.3 
 
 
157 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1854  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70 
 
 
185 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.771185  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2516  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  70 
 
 
176 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3672  putative oxidoreductase  70.34 
 
 
163 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43780  putative oxidoreductase  69.66 
 
 
163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2136  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70 
 
 
155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0799227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70.07 
 
 
157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2314  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  70.2 
 
 
180 aa  207  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0662  putative oxidoreductase alpha subunit  66.67 
 
 
172 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704314  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4546  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.32 
 
 
167 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.945817  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4331  (2Fe-2S)-binding domain protein  66.67 
 
 
172 aa  204  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3926  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  71.94 
 
 
180 aa  203  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4323  (2Fe-2S)-binding  67.12 
 
 
167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3482  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.12 
 
 
167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109016 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4043  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  67.12 
 
 
167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281878  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4059  (2Fe-2S)-binding  64.47 
 
 
165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3006  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.13 
 
 
178 aa  190  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1668  (2Fe-2S)-binding protein  67.32 
 
 
196 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0567984  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2492  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.09 
 
 
157 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1182  (2Fe-2S)-binding  58.78 
 
 
150 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6040  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.79 
 
 
174 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0163802  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3375  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.05 
 
 
155 aa  179  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3138  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.4 
 
 
156 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1906  (2Fe-2S)-binding  57.24 
 
 
164 aa  177  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0622007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0189  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.49 
 
 
167 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0236  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.67 
 
 
156 aa  174  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6357  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
166 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198783  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7023  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
166 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.033911  normal  0.21253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1471  (2Fe-2S)-binding  54.05 
 
 
166 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398834  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5704  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.42 
 
 
164 aa  166  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8450  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.72 
 
 
156 aa  166  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5602  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
166 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5819  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  54.05 
 
 
166 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3931  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.11 
 
 
195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0278463  normal  0.0911563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2899  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.7 
 
 
155 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0288309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5505  (2Fe-2S)-binding domain protein  53.02 
 
 
170 aa  163  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00465731  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2447  ferredoxin  51.95 
 
 
157 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322447  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4957  ferredoxin/(2Fe-2S)-binding protein  52.7 
 
 
166 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.926998  normal  0.121589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1931  (2Fe-2S)-binding protein  50.67 
 
 
154 aa  155  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0594  (2Fe-2S)-binding  49.66 
 
 
152 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98773  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1416  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.68 
 
 
154 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3111  (2Fe-2S)-binding protein  53.19 
 
 
153 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.215766  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  49.67 
 
 
152 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  51.01 
 
 
155 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.32 
 
 
171 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02378  Ferredoxin/oxidoreductase  45.75 
 
 
168 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.458538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2767  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  48.32 
 
 
149 aa  147  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0896  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  49.01 
 
 
168 aa  147  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.419158  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  50.68 
 
 
154 aa  147  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  52.03 
 
 
146 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847005  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2354  (2Fe-2S)-binding domain protein  51.7 
 
 
158 aa  147  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  47.68 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4125  (2Fe-2S)-binding domain protein  54.79 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  50 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  46 
 
 
187 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  46.36 
 
 
153 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2506  putative oxidoreductase, alpha subunit  41.32 
 
 
176 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674684  normal  0.179187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  46.75 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  47.06 
 
 
170 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.97 
 
 
162 aa  144  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.44 
 
 
177 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  44.74 
 
 
155 aa  144  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2833  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.34 
 
 
151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120723  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2473  ferredoxin  47.65 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411449  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.99 
 
 
153 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.33 
 
 
151 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.32 
 
 
155 aa  143  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1074  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.35 
 
 
146 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0838259  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.33 
 
 
151 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1037  (2Fe-2S)-binding  50.67 
 
 
179 aa  143  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.365772  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  47.33 
 
 
151 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  48.99 
 
 
156 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  48.32 
 
 
152 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  48.3 
 
 
151 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.65 
 
 
151 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  46.31 
 
 
151 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6324  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  50 
 
 
156 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.633542  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  46.67 
 
 
151 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.67 
 
 
151 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.67 
 
 
151 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2287  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  46.26 
 
 
148 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.418047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.28 
 
 
151 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.75 
 
 
155 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  45.75 
 
 
155 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4569  (2Fe-2S)-binding domain protein  48.05 
 
 
155 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  45.75 
 
 
155 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3046  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.7 
 
 
155 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1159  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  44.97 
 
 
149 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  48.28 
 
 
151 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0177  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.62 
 
 
152 aa  141  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0550651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3868  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  53.79 
 
 
181 aa  140  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505784  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0123  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
155 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298276  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4228  (2Fe-2S)-binding  48 
 
 
163 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  45.89 
 
 
450 aa  140  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2112  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  48.34 
 
 
151 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1346  (2Fe-2S)-binding protein  44.51 
 
 
175 aa  140  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2296  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.68 
 
 
151 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>